Bolsa de PD em Botânica no IB/USP

Post doctoral fellowship in Botany at IB/USP

Nº: 954

Área de conhecimento: Botânica

Field of knowledge: Botany

Nº do processo FAPESP: 2014/18002-2

FAPESP process: 2014/18002-2

Título do projeto: Sapindales: filogenia e diversificação na região neotropical

Project title: Sapindales: phylogeny and diversification in the neotropical region

Área de atuação: Citogenética

Working area: Cytogenetics

Pesquisador principal: José Rubens Pirani

Principal investigator: José Rubens Pirani

Unidade/Instituição: Instituto de Biociências / Universidade de São Paulo

Unit/Instituition: Instituto de Biociências / Universidade de São Paulo

Data limite para inscrições: 21/11/2015

Deadline for submissions: 2015-11-21

Publicado em: 27/10/2015

Publishing date: 2015-10-27

Localização: Instituto de Biociências, São Paulo

Locale: Instituto de Biociências, São Paulo

  • Resumo Summary

    1. Informações gerais 
    1.1 Projeto temático: Sapindales: filogenia e diversificação na região neotropical (FAPESP: 14/18002-2).
    1.2 Sub-área do projeto de pós-doutorado: Citogenética Vegetal.
    1.3 Pesquisadores principais: José Rubens Pirani e Pedro Dias.
    1.4 Supervisor para este projeto: José Rubens Pirani.
    1.5 Instituição / Departmento: Universidade de São Paulo - Instituto de Biociências - Departmento de Botânica.
    1.6 Bolsa: R$ 6.143,40 por mês.
    1.7 Reserva técnica de bolsa: destina-se à utilização em atividades desenvolvidas pelo bolsista, estritamente relacionadas com o projeto de pesquisa da bolsa, no período de vigência da mesma. O valor adicional é equivalente a 15% do valor anual da bolsa. 
    1.8 Data limite para inscrição: 21 de novembro de 2015.

    2. Descrição do projeto
    Sequências repetitivas em Sapindales: impactos evolutivos em uma escala global” - As Sapindales apresentam número cromossômico e tamanho do genoma altamente variável e essas carcterísticas geralmente estão associadas a sequências repetitivas. Esta proposta visa:
    (1) analisar o tamanho do genoma por citometria de fluxo em representantes das diferentes famílias da ordem Sapindales e determinar o número cromossômico a partir de técnicas de coloração convencional; 
    (2) reconhecer sequências de DNA repetitivo de interesse em espécies selecionadas (e.g., elementos transponíveis e DNA satélite) mediante sequenciamento de nova geração e mapeamento físico usando FISH; 
    (3) estudar a relação entre a variação do conteúdo de DNA e a diversidade cariotípica das espécies e gêneros selecionados. 

    3. Atividades
    A bolsa faz parte de um projeto de pesquisa financiado pela FAPESP (2014/18002-2), com instituição-sede na Universidade de São Paulo, sobre a filogenia e a diversificação das Sapindales na região neotropical. As atividades a serem desenvolvidas incluem o uso de técnicas usuais em citogenética, assim como de citometria de fluxo, FISH e sequenciamento de nova geração. 

    Durante o primeiro ano, o bolsista terá de adquirir experiência com a preparação de amostras para as plataformas Illumina. O bolsista também ajudará com a orientação de alunos (especialmente de pós-graduação) e na escrita de manuscritos e propostas para financiamento por agências de fomento. 

    As atividades de laboratório serão realizadas nos Laboratórios de Sistemática Vegetal do Departamento de Botânica e Biomedicina da Escola de Artes, Ciências e Humanidades, da Universidade de São Paulo, em São Paulo; e no laboratório de Biossistemática e Polinização da Universidade Estadual de Campinas, em Campinas.

    4. Requisitos 
    Para concorrer à vaga, o candidato precisa:
    4.1 Ter título de doutor em Citogenética, Sistemática, Filogenética, Biologia Evolutiva ou áreas correlatas, com tese desenvolvida em Citogenética de plantas. O título não pode ter sido obtido há mais de três anos da data limite para inscrição.
    4.2 Ter publicação em citogenética usando FISH (se em Sapindales, será um diferencial).
    4.3 Ter inglês fluente (fala e escrita) e disponibilidade para viajar para fora do país. 
    4.4 Ter experiência com técnicas de citogenética vegetal usando fluorescência (e.g., FISH) e citometria de fluxo (conhecimento de técnicas de sequenciamento de nova geração será um diferencial). 
    4.5 Disponibilidade para iniciar as atividades tão logo a FAPESP aprove a seleção. 
    * É vetada a inscrição de candidatos aposentados. 

    5. Critérios para seleção
    Entre os candidatos com inscrição aprovada, a seleção será feita de acordo com o mérito científico dos candidatos, a qualidade da tese de doutorado, habilidades pessoais, a intimidade do candidato com áreas de interesse para o projeto, a habilidade de falar e escrever em inglês, habilidade analítica, criatividade, iniciativa, independência, trabalho em grupo e disposição para colaborações. 

    Experiência prévia com Sapindales e conhecimento de teorias e métodos relevantes (FISH, citometria de fluxo, sequenciamento de nova geração) serão considerados fortes diferenciais. Experiência com trabalho de campo, trabalho taxonômico e atividades básicas em laboratório de biologia molecular serão consideradas como habilidades adicionais.
     
    Omissões neste edital serão resolvidas pelos pesquisadores principais do projeto temático, levando em conta as regras da FAPESP (www.fapesp.br/en/5427). 

    6. Mais informações 
    Por favor, contate José R. Pirani (pirani@usp.br) ou Pedro Dias (pdias@usp.br).
     
    7. A ser encaminhado para se candidatar
    7.1
    Carta de intenção, com apresentação pessoal, de no máximo uma página A4, com as razões que fizeram você se inscrever.
    7.2 Curriculum vitae com lista de publicações (por favor, inclua os links DOI).
    7.3 Cópia de três publicações selecionadas. Cópia da tese de doutorado e do título de doutor ou ainda uma declaração com a data em que a tese será defendida (até 30 de novembro de 2015).
    7.4 Fornecer nomes de duas referências pessoais que possam emitir juízo sobre você (com endereços eletrônicos).
     
    Por favor, envie sua documentação por e-mail (em formato PDF), marcada com "FAPESP 2014/18002-2 - PD4 - Cytogenetics" no campo assunto, para pirani@usp.br e pdias@usp.br, até o dia 21 de novembro de 2015.

    A análise da documentação e a seleção serão realizadas no dia 23 de novembro de 2015, mas é possível que a data limite seja estendida até que a vaga seja preenchida.

    1. General information
    1.1 Grant:
    Sapindales: phylogeny and diversification in the neotropical region (FAPESP: 14/18002-2).
    1.2 Project sub-discipline: Plant Cytogenetics.
    1.3 Principal investigators: José Rubens Pirani and Pedro Dias.
    1.4 Supervisor for this project: José Rubens Pirani.
    1.5 Institution / Department: University of São Paulo - Biosciences Institute - Department of Botany.
    1.6 Fellowship: R$ 6.143,40 per month (there are no taxes on fellowships in Brazil).
    1.7 Research contingency funds: intended for use in activities developed by the fellowship holder, strictly related to the fellowship research project, during the term of the fellowship. The additional funds are equivalent to 15 per cent of the annual value of the fellowship.
    1.8 Deadline for application: November 21, 2015.

    2. Project description
    Repetitive DNA in Sapindales: evolutionary impacts at a global scale” - Sapindales representatives have highly variable chromossome numbers and genome sizes, which are usually associated with repetitive DNA. The fellow will investigate:
    (1) chromossome numbers and genome sizes, 
    (2) repetitive DNA (e.g., transposons and satellite DNA), and 
    (3) evolutionary patterns in DNA content and caryotypes. 

    This project will use flow cytometry, standard painting and FISH techniques. Also, llumina sequencing technology will be used. 

    3. Tasks 
    The position is part of a research project, supported by FAPESP (2014/18002-2) at University of São Paulo, on the phylogeny and diversification of the Sapindales in the Neotropical region. The work includes the use of flow cytometry, standard painting and FISH techniques. 

    During the first year, the fellow is requested to acquire abilities on sample preparation to Illumina platforms. The labwork will be conducted at two labs: Plant Systematics Laboratory of the Department of Botany and Biomedicine of the School of Arts, Science and Humanity, at University of São Paulo, in São Paulo; and Biosystematics and Pollination of the State University of Campinas, in Campinas.

    4. Qualifications
    To be qualified for the postdoctoral position the applicant should have: 
    4.1 PhD degree in Cytogenetics, Systematics, Phylogenetics, Evolutionary Biology or similar direction of studies, and PhD dissertation on plant cytogenetics. The PhD degree should have been received no more than three years before the deadline for applications.
    4.2 Publication record in floral anatomy and morphology (if in Sapindales, it will be a plus). 
    4.3 Fluent English and availability to spend sometime abroad. 
    4.4 Experience with cytogenetics techniques, flow cytometry, and FISH. 
    4.5 Availability to initiate working on the project as soon as FAPESP finishes documentation checking and approves the application. 
    * Retired candidates are not allowed.
     
    5. Criteria for selection
    Among qualified applicants, selection will be made according to scientific merits, quality of the PhD dissertation, personal skills, the applicant's documented knowledge in subjects of relevance for the research area, ability to master English language (both spoken and written), analytical ability, creativity, initiative, independence, teamwork and ability to cooperate. 

    Previous experience with Sapindales and knowledge of relevant theory and methods (phylogenetic analyses) weigh heavily. Experience with botanical fieldwork, taxonomic work, and DNA labwork are considered as additional qualifications. 

    Omissions in this announcement will be decided by the PI of the FAPESP grant, safeguarding the rules established by FAPESP (www.fapesp.br/en/5427). 

    6. More information
    Please contact José R. Pirani (pirani@usp.br) or Pedro Dias (pdias@usp.br).
     
    7. To be included in the application (pdf format only) 
    7.1 Maximum one A4-page of personal presentation and your reasons for applying (letter of intent).
    7.2 Curriculum vitae with publication list (please include DOI links).
    7.3 Copy of three selected publications. Copy of PhD dissertation and PhD degree certificate or date of scheduled defense (until November 30, 2015).
    7.4 A list of two persons who may act as references (with e-mail addresses).
     
    Please send your application, marked with "FAPESP 2014/18002-2 - PD4 - Cytogenetics" in the subject field, to both pirani@usp.br and pdias@usp.br no later than November 21, 2015. 

    Applications will be reviewed on November 23, 2015, but are also considered after this date until the position is filled.