Bolsa de PD em Biologia Celular

Post doctoral fellowship in Cell Biology

Nº: 1058

Área de conhecimento: Biologia Geral

Field of knowledge: General biology

Nº do processo FAPESP: 2015/50040-4

FAPESP process: 2015/50040-4

Título do projeto: Centro de Excelência para Descoberta de Alvos Moleculares

Project title: Centre of Excellence for Research in Target Discovery

Área de atuação: Biologia Celular

Working area: Cell Biology

Pesquisador principal: Ana Marisa Chudzinski-Tavassi

Principal investigator: Ana Marisa Chudzinski-Tavassi

Unidade/Instituição: Centre of Excellence for Research in Target Discovery / Instituto Butantan

Unit/Instituition: Centre of Excellence for Research in Target Discovery / Instituto Butantan

Data limite para inscrições: 14/04/2016

Deadline for submissions: 2016-04-14

Publicado em: 11/03/2016

Publishing date: 2016-03-11

Localização: Av. Vital Brasil, 1500 São Paulo

Locale: Av. Vital Brasil, 1500 São Paulo

  • Resumo Summary

    Título do projeto: Alvos terapêuticos epigenômicos: Perfil de miRNA em um modelo in vitro de osteoartrite tratado com rLosac (PD-1).

    O Centro de Excelência para Descoberta de Alvos Moleculares, resultado de nova parceria envolvendo FAPESP, Glaxo-SmithKline e Instituto Butantan, tem uma vaga disponível para Pós-Doutorado no Laboratório de Bioquímica e Biofísica do Instituto Butantan, São Paulo, Brasil.

    O candidato selecionado irá contribuir com a identificação, elucidação e validação de novos alvos/vias envolvidos em doenças relacionadas com processos inflamatórios, tais como osteoartrite, câncer, remodelagem tecidual, artrite reumatoide, doenças metabólicas e neurodegenerativas.

    O grupo emprega uma abordagem interdisciplinar, combinando o uso de compostos naturais a partir de fontes animais (veneno total, secreções animais, toxinas purificadas, peptídeos derivados de toxina e novas moléculas presentes em bibliotecas de cDNA), metodologias moleculares e celulares, técnicas de microscopia de alto rendimento, abordagens bioinformáticas, formalismos computer-aided molecular design (CAMD), proteômica e análise de expressão gênica, para criar uma abordagem racional na procura de alvos moleculares envolvidos em eventos de inflamação e sobrevivência celular.

    Como requisitos, os candidatos devem ter doutorado em Biologia Molecular, Biotecnologia ou áreas afins, habilidade em microscopia de alto rendimento e conhecimento de bioinformática para análise de microarranjos (microarrays), PCR em tempo real, boas práticas de laboratório (BPL), análise de sequenciamento de nova geração e técnicas de imagem. Experiência com microRNA constitui uma vantagem (mas não requisito).

    É importante ter pelo menos um artigo científico como primeiro autor em revista internacional indexada, ser fluente em inglês, ter boas habilidades na escrita e motivação para resolver problemas biológicos complexos no campo da descoberta de alvos.

    Os candidatos interessados devem apresentar seus pedidos incluindo uma carta de apresentação descrevendo suas realizações de pesquisa, CV e duas cartas de recomendação. Por favor, envie o pedido para Dr. Ana Marisa Chudzinski Tavassi (To: centd@butantan.gov.br / Cc: ana.chudzinski@butantan.gov.br).

    Esta oportunidade está aberta para candidatos de qualquer nacionalidade. O candidato selecionado receberá da FAPESP uma bolsa de Pós-Doutorado no valor de R$ 6.143,40 mensais e uma reserva técnica equivalente a 15% do valor anual da bolsa e que deverá ser utilizada na compra de materiais diretamente relacionados com as atividades de pesquisa.

    Os candidatos que precisem se deslocar para a cidade onde está localizada a sede da instituição de pesquisa podem solicitar o benefício financeiro de Auxílio Instalação, compreendendo:
    - Uma (1) bolsa mensal adicional a ser paga juntamente com o primeiro mês da bolsa;
    - Custos de transporte, se houver deslocamento por distância superior a 350km (visite: www.fapesp.br/en/5427).

    Prazo para candidaturas: 14 de abril de 2016.
    Início das inscrições: 14 de março de 2016.
    Duração: Inicialmente 2 anos com opção de prorrogação.
    Auxílio: 2015/50040-4, FAPESP.

    Projeto
    MicroRNAs, uma classe de pequenos RNAs não codificantes, evolutivamente conservados, com 20-23 nucleotídeos em média, amplamente expressos em diferentes tipos de células e tecidos. Eles desempenham papel regulador fundamental em uma variedade de vias metabólicas, eventos celulares e processos fisiológicos, como a resposta imune, patogênese do câncer e doenças inflamatórias, incluindo osteoartrite (OA), artrite reumatoide e condições neuroinflamatórias.

    Um grande corpo de literatura estabelece que o envelhecimento dos condrócitos está associado com a degeneração da cartilagem articular, que é normalmente observada na patogênese das doenças articulares, tais como artrite reumatóide e OA.

    Em estudos preliminares in vitro com condrócitos isolados, rLosac (uma forma recombinante da proteína isolada a partir da lagarta Lonomia obliqua) foi verificado como um agente anti-apoptótico eficaz e com um efeito citoprotector em 48h e 72h de tratamento.

    Além disso, o rLosac foi capaz de reduzir a expressão da β-galactosidase induzida pela IL-1β, o que sugere que rLosac pode ter o potencial de prevenir as características de senescência em condrócitos osteoartríticos.

    Considerando-se os efeitos protetores do rLosac neste modelo de OA e o possível envolvimento de microRNAs na regulação dessas vias, o principal objetivo deste projeto é determinar um perfil de microRNA em condrócitos tratados com rLosac para determinar as vias de citoproteção ativadas e relacionar com prováveis alvos para OA.

    Project title: Epigenomic therapeutic targets: miRNA profile in an in vitro model of osteoarthritis treated with rLosac (PD-1).

    The Centre of Excellence for Research in Target Discovery, a new partnership among FAPESP, Glaxo-Smith Kline and Butantan Institute, has a postdoctoral position available in the Laboratory of Biochemistry at Butantan Institute, São Paulo, Brazil.

    The successful applicant will contribute to an international competitive research on the identification, elucidation and validation of novel targets/pathways involved in inflammatory related diseases, such as osteoarthritis, cancer, tissue remodeling, rheumatoid arthritis, metabolic and neurodegenerative diseases.

    The group employs an interdisciplinary approach, combining the use of natural compounds from animal sources (whole venoms, animal secretions, purified toxins, toxin derived peptides and new molecules from cDNA libraries), molecular and cell biological methodologies, state-of-the-art high-throughput microscopy techniques, bioinformatics approaches, formalisms of computer-aided molecular design (CAMD), proteomics and gene expression analysis, to create a rational approach for searching molecular targets involved in inflammatory events and cell survival.

    The successful applicant will:
    - Obtain training in high-throughput microscopy, epigenetics.
    - Collaborate with internal and external partners.
    - Work in close cooperation with a team of researchers to facilitate novel discoveries.

    As requirements, candidates should have PhD in Molecular Biology, Biotechnology or related areas; at least one first author paper in an international peer reviewed journal; motivation to solve complex biological problems in the field of target discovery and to productively work in an interdisciplinary environment; fluent English with good writing skills; knowledge of bioinformatics for microarrays analysis, real time PCR and laboratory good practices.

    Next sequencing generation analysis, imaging related techniques and experience working with microRNA are advantages (but not requirements).

    Interested applicants should submit an application including a cover letter outlining research accomplishments, CV, and two recommendation letters. Please send the application to Dr. Ana Marisa Chudzinski Tavassi (To: centd@butantan.gov.br / Cc: ana.chudzinski@butantan.gov.br).

    This opportunity is open to candidates of any nationalities. The selected candidate will receive a FAPESP's Post-Doctoral fellowship in the amount of R$ 6,143.40 monthly and a research contingency fund, equivalent to 15% of the annual value of the fellowship which should be spent in items directly related to the research activity.

    Those who need to move to the city where is located the headquarters of the research institution may request the benefit Installation financial assistance, comprising:
    - One (1) additional monthly fee to be paid along with the first month of the fellowship;
    - Transportation costs, in case of any displacement exceeding 350km (visit www.fapesp.br/en/5427).

    Deadline for applications: April 14, 2016.
    Starting date for applications: March 14, 2016.
    Duration: Initially 2 years with option of further extension.
    Grant: 2015/50040-4, São Paulo Research Foundation (FAPESP).

    Project

    MicroRNAs are evolutionary conserved and the ubiquitous class of small non-codings RNAs, with 20-23 nucleotides on average, broadly expressed in different cell types and tissues. They play crucial regulatory role in a variety of metabolic pathways, cellular events and physiological process, such as immune response, pathogenesis of cancer and inflammatory-related diseases, including osteoarthritis, rheumatoid arthritis and neuroinflammatory conditions.

    A large body of literature establishes that chondrocytes aging is associated with the degeneration of articular cartilage, which is commonly observed in the pathogenesis of joint diseases, such as rheumatoid arthritis and osteoarthritis (OA).

    In preliminary in vitro studies with isolated chondrocytes, rLosac (a recombinant form of the protein isolated from Lonomia obliqua caterpillar) has been found to be an effective anti-apoptotic agent and has cytoprotective effect in 48h and 72h treatments.

    Moreover, rLosac was able to reduce the IL-1β-induced expression of β-galactosidade, suggesting that rLosac may have the potential to prevent the features of senescence in OA chondrocytes.

    Considering the protective effects of rLosac in this model of OA and the possible involvement of miRNAs in the regulation of these pathways, the main objective of this project is to determine a miRNA profile in chondrocytes treated with rLosac for determining the activated pathways for cytoprotection and to relate with probable targets for osteoarthritis.