Bolsa de PD em Biologia Molecular / Sequenciamento Genético / Análise de Bioinformática / Coordenação de Equipe
Post-Doctoral Fellowship in Molecular Biology / Genetic Sequencing / Bioinformatics Analysis / Team Coordination
Nº: 7212
Área de conhecimento: Medicina
Field of knowledge: Medicine
Nº do processo FAPESP: 2023/09965-0
FAPESP process: 2023/09965-0
Título do projeto: SOMOS RAROS mas SOMOS MUITOS: Desenvolvimento de uma plataforma de referência para diagnóstico genético e orientação clínica via telemedicina de pacientes com Doenças Raras, em conformidade com as diretrizes do DECIT/SUS
Project title: Rare diseases are rare, but rare diseases patients are numerous: Development of a reference platform for genetic diagnosis and clinical counseling via telemedicine for patients with Rare Diseases, in accordance with DECIT/SUS guidelines
Área de atuação: Biologia Molecular / Sequenciamento Genético / Análise de Bioinformática / Coordenação de Equipe / Coordenação de Projeto
Working area: Molecular Biology / Genetic Sequencing / Bioinformatics Analysis / Team Coordination / Project Coordination
Quantidade de vagas: 1
Number of places: 1
Pesquisador responsável: Magda Maria Sales Carneiro Sampaio
Principal investigator: Magda Maria Sales Carneiro Sampaio
Unidade/Instituição: Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo (FM-USP)
Unit/Instituition: Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo (FM-USP)
Data limite para inscrições: 31/07/2024
Deadline for submissions: 2024-07-31
Publicado em: 10/07/2024
Publishing date: 2024-07-10
Localização: Av. Dr. Enéas Carvalho de Aguiar, 255 – Prédio dos Ambulatórios, Hospital das Clínicas (PAMB-HC), 2º andar, Bloco 08, São Paulo
Locale: Av. Dr. Enéas Carvalho de Aguiar, 255 – Prédio dos Ambulatórios, Hospital das Clínicas (PAMB-HC), 2º andar, Bloco 08, São Paulo
E-mail para inscrições: cigensequenciamento@gmail.com
E-mail for proposal submission: cigensequenciamento@gmail.com
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Resumo
Summary
Atividades:
- Gestão de dados clínicos e amostras, além da criação e gerenciamento de um banco central de dados com resultados de testes genéticos prévios de análise do genoma codificante (exoma);
- Desenvolvimento de algoritmos para a identificação e seleção com casos inconclusivos;
- Treinamento para interpretação dos dados do metiloma e genoma completo;
- Análise dos dados genômicos, com aplicação de ferramentas de bioinformática ou do uso de plataformas de análises, segundo as recomendações vigentes;
- Compilação dos resultados e discussão dos dados com equipe multidisciplinar;
- Preparo de Relatórios Científicos;
- Preparo e submissão de artigos científicos a periódicos relevantes à área.Requisitos:
- Disponibilidade para desenvolvimento das atividades presencialmente de 2ª a 6ª feira, das 9h às 18h;
- Experiência mínima de 3 anos como pós-doutor, atuando em projetos científicos e com vínculo institucional;
- Experiência mínima de 3 anos com organização e manipulação de bancos de dados de projetos de pesquisa de grande porte (mais de 5);
- Inglês fluente;
- Experiência de pelo menos 4 anos em coordenação de projetos científicos;
- Experiência de pelo menos 4 anos em coordenação de equipes e pessoas em projetos científicos;
- Experiência de pelo menos 5 anos em diferentes técnicas de biologia molecular e sequenciamento genético por diferentes plataformas;
- Experiência de pelo menos 4 anos em sequenciamento e análise de genoma;
- Experiência e habilidade no treinamento e formação de equipes.A vaga está aberta a brasileiros e estrangeiros. O selecionado receberá Bolsa de Pós-Doutorado da FAPESP no valor de R$ 12.000,00 mensais (em vigor a partir de 01/08) e Reserva Técnica equivalente a 10% do valor anual da bolsa para atender a despesas imprevistas e diretamente relacionadas à atividade de pesquisa.
Activities:
- Management of clinical data and samples, as well as the creation and management of a central database with results from previous genetic tests of coding genome analysis (exome);
- Development of algorithms for the identification and selection of inconclusive cases;
- Training for the interpretation of methylome and whole genome data;
- Analysis of genomic data, applying bioinformatics tools or analysis platforms according to current recommendations;
- Compilation of results and discussion of data with a multidisciplinary team;
- Preparation of scientific reports;
- Preparation and submission of scientific articles to relevant journals in the field.Requirements:
- Availability to perform activities in person from Monday to Friday from 9 AM to 6 PM;
- Minimum of 3 years of post-doctoral experience, working on scientific projects with institutional affiliation;
- Minimum of 3 years of experience in organizing and handling large-scale research project databases (more than 5);
- Fluent English;
- At least 4 years of experience in coordinating scientific projects;
- At least 4 years of experience in coordinating teams and people in scientific projects;
- At least 5 years of experience in various molecular biology techniques and genetic sequencing on different platforms;
- At least 4 years of experience in genome sequencing and analysis;
- Experience and teaching skills in training and forming teams.The fellow will be based at the University of São Paulo's Medical School (FM-USP) in Brazil.
This opportunity is open to candidates of any nationality. The selected candidate will receive a Post-Doctoral fellowship from the São Paulo Research Foundation (FAPESP) in the amount of R$ 12,000.00 monthly (in force starting August 1st) and a research contingency fund, equivalent to 10% of the annual value of the fellowship which should be spent on items directly related to the research activity.
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