Bolsa de TT-V em Bioinformática
Level 5-Technical Training Fellowship in Bioinformatics
Nº: 7493
Área de conhecimento: Biologia Geral
Field of knowledge: General biology
Nº do processo FAPESP: 2021/10577-0
FAPESP process: 2021/10577-0
Título do projeto: Análise de genomas, transcriptomas e proteomas
Project title: Genomic, Transcriptomic and Proteomic Analyses
Área de atuação: Bioinformática
Working area: Bioinformatics
Quantidade de vagas: 1
Number of places: 1
Pesquisador responsável: Shaker Chuck Farah
Principal investigator: Shaker Chuck Farah
Unidade/Instituição: Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo (ICB-USP)
Unit/Instituition: Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo (ICB-USP)
Data limite para inscrições: 10/11/2024
Deadline for submissions: 2024-11-10
Publicado em: 15/10/2024
Publishing date: 2024-10-15
Localização: Avenida Professor Lineu Prestes, 1374 (ICB II), São Paulo
Locale: Avenida Professor Lineu Prestes, 1374 (ICB II), São Paulo
E-mail para inscrições: cepid-b3@iq.usp.br
E-mail for proposal submission: cepid-b3@iq.usp.br
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Resumo
O bolsista irá atuar no âmbito do Centro de Pesquisa em Biologia de Bactérias e Bacteriófagos (CEPID B3) – um Centro de Pesquisa, Inovação e Difusão apoiado pela FAPESP com sede no ICB-USP – aplicando e desenvolvendo novos métodos, software e rotinas de análise (pipelines) em genômica, transcriptômica e genômica comparativa de bactérias e fagos. Entre suas atribuições, o bolsista irá:
- Executar softwares e pipelines de montagem e anotação de genomas;
- Participar do desenho experimental e executar as análises computacionais e estatísticas de RNA-seq, Tn-Seq e outros métodos de coleta de dados em larga escala baseados em sequenciamento;
- Desenvolver, disponibilizar e publicar os scripts implementados;
- Prover suporte e treinamento aos usuários do CEPID.Requisitos mínimos:
- Doutorado em projetos de bioinformática envolvendo uso e/ou desenvolvimento de pipelines e softwares usados de análise de dados genômico, transcriptômicos e correlatos;
- Experiência com montagem/gerenciamento de pipelines de bioinformática com aplicações em genômica, transcriptômica e/ou biologia estrutural;
- Experiência no desenvolvimento de scripts e domínio de linguagens de programação Python e R.Competências diferenciadoras:
- Experiência no desenvolvimento de algoritmos de análise em bioinformática;
- Conhecimento de métodos de análises de dados e proficiência no uso de estatística.Os interessados deverão enviar seu CV, carta de interés e de recomendação por e-mail.
Mais informações sobre requisitos e benefícios da Bolsa FAPESP de Treinamento Técnico nível cinco (TT-V) estão disponíveis em https://fapesp.br/3098 e https://fapesp.br/3162.
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Oportunidade - Oportunidades Abertas Open Opportunities
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