Bolsa de TT-V em Bioinformática

Level 5-Technical Training Fellowship in Bioinformatics

Nº: 7493

Área de conhecimento: Biologia Geral

Field of knowledge: General biology

Nº do processo FAPESP: 2021/10577-0

FAPESP process: 2021/10577-0

Título do projeto: Análise de genomas, transcriptomas e proteomas

Project title: Genomic, Transcriptomic and Proteomic Analyses

Área de atuação: Bioinformática

Working area: Bioinformatics

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Pesquisador responsável: Shaker Chuck Farah

Principal investigator: Shaker Chuck Farah

Unidade/Instituição: Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo (ICB-USP)

Unit/Instituition: Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo (ICB-USP)

Data limite para inscrições: 10/11/2024

Deadline for submissions: 2024-11-10

Publicado em: 15/10/2024

Publishing date: 2024-10-15

Localização: Avenida Professor Lineu Prestes, 1374 (ICB II), São Paulo

Locale: Avenida Professor Lineu Prestes, 1374 (ICB II), São Paulo

E-mail para inscrições: cepid-b3@iq.usp.br

E-mail for proposal submission: cepid-b3@iq.usp.br

  • Resumo

    O bolsista irá atuar no âmbito do Centro de Pesquisa em Biologia de Bactérias e Bacteriófagos (CEPID B3) – um Centro de Pesquisa, Inovação e Difusão apoiado pela FAPESP com sede no ICB-USP – aplicando e desenvolvendo novos métodos, software e rotinas de análise (pipelines) em genômica, transcriptômica e genômica comparativa de bactérias e fagos. Entre suas atribuições, o bolsista irá:

    - Executar softwares e pipelines de montagem e anotação de genomas;
    - Participar do desenho experimental e executar as análises computacionais e estatísticas de RNA-seq, Tn-Seq e outros métodos de coleta de dados em larga escala baseados em sequenciamento;
    - Desenvolver, disponibilizar e publicar os scripts implementados;
    - Prover suporte e treinamento aos usuários do CEPID.

    Requisitos mínimos:

    - Doutorado em projetos de bioinformática envolvendo uso e/ou desenvolvimento de pipelines e softwares usados de análise de dados genômico, transcriptômicos e correlatos;
    - Experiência com montagem/gerenciamento de pipelines de bioinformática com aplicações em genômica, transcriptômica e/ou biologia estrutural;
    - Experiência no desenvolvimento de scripts e domínio de linguagens de programação Python e R.

    Competências diferenciadoras:

    - Experiência no desenvolvimento de algoritmos de análise em bioinformática;
    - Conhecimento de métodos de análises de dados e proficiência no uso de estatística.

    Os interessados deverão enviar seu CV, carta de interés e de recomendação por e-mail.

    Mais informações sobre requisitos e benefícios da Bolsa FAPESP de Treinamento Técnico nível cinco (TT-V) estão disponíveis em https://fapesp.br/3098 e https://fapesp.br/3162.