Bolsa de PD em Fisiologia, Transcriptoma e Metabolômica do Café

Post-doctoral Fellowship in Plant Physiology, Transcriptomics and Metabolomics

Nº: 3165

Área de conhecimento: Agronomia

Field of knowledge: Agronomy

Nº do processo FAPESP: 2018/08042-8

FAPESP process: 2018/08042-8

Título do projeto: Uma abordagem sistema para compreensão do impacto de mudanças climáticas em Coffea spp

Project title: A systems approach to understand the impact of climate changes in Coffea spp

Área de atuação: Fisiologia, Transcriptômica e Metabolômica Vegetal

Working area: Plant Physiology, Transcriptomics and Metabolomics

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Pesquisador principal: Douglas Silva Domingues

Principal investigator: Douglas Silva Domingues

Unidade/Instituição: IB/UNESP/Rio Claro

Unit/Instituition: IB/UNESP/Rio Claro

Data limite para inscrições: 13/10/2019

Deadline for submissions: 2019-10-13

Publicado em: 11/09/2019

Publishing date: 2019-09-11

Localização: Av. 24 A, 1515 - Jardim Vila Bela, Rio Claro

Locale: Av. 24 A, 1515 - Jardim Vila Bela, Rio Claro

E-mail para inscrições: douglas.domingues@unesp.br

E-mail for proposal submission: douglas.domingues@unesp.br

  • Resumo Summary

    Oportunidade para obtenção de bolsa de pós-doutorado para atuar em pesquisa sobre o impacto de mudanças climáticas na fisiologia e metabolismo de cafeeiro arábica.

    O objetivo é compreender o efeito da interação entre alta concentração de CO2 atmosférico e disponibilidade de água em Coffea arabica, por meio de análises ecofisiológicas, de expressão de genes e identificação/quantificação de metabólitos.

    O projeto que suporta esta vaga será focado em:

    i) observar a modulação de parâmetros de crescimento, de fotossíntese e captação/assimilação de CO2, em função dos tratamentos impostos (Ecofisiologia Vegetal);
    ii) investigar a modulação do transcriptoma de C. arabica (Transcriptômica vegetal);
    iii) identificar metabólitos, em especial poliois e metabólitos secundários, modulados em folhas de C. arabica (Metabolômica Vegetal);
    iv) identificar e associar dados fisiológicos/transcritos/metabólitos que possam conferir vantagens ao metabolismo de C. arabica em um cenario de mudanças climáticas (Bioinformática).

    O grupo de pesquisa do projeto envolve três instituições do Estado de São Paulo: UNESP/Rio Claro, Instituto de Botânica de São Paulo e Universidade Federal do ABC (UFABC). Envolve ainda uma colaboração com grupos da pesquisa do Instituto Superior de Agronomia, Universidade de Lisboa, Portugal.

    Perfil e Habilidades desejáveis

    O candidato selecionado atuará em todas as frentes do projeto. Espera-se, nesse sentido, que sua formação de doutorado contemple ao menos uma das quatro áreas acima colocadas, com interesse e disposição para receber treinamento e posteriormente conduzir experimentos nas demais áreas do projeto.

    No entanto, evidências de experiência prática de trabalho em ecofisiologia de plantas lenhosas serão consideradas um diferencial positivo.

    O candidato selecionado também será envolvido no planejamento e execução de projetos de pesquisa e poderá atuar na co-orientação de estudantes de pós-graduação e graduação. O profissional deverá ter familiaridade com ferramentas de busca bibliográfica, saber planejar e conduzir experimentos de forma independente. São ainda necessários bom domínio do inglês escrito e falado, assim como grande interesse e facilidade para trabalhar em ambiente de laboratórios interdisciplinares e disposição para viagens regulares entre as três instituições paulistas envolvidas no projeto.

    - Período: um a três anos, dependendo do desempenho.

    - Início esperado: provavelmente novembro/2019

    - A vaga está aberta a brasileiros e estrangeiros. O selecionado receberá Bolsa de Pós-Doutorado da FAPESP no valor de R$ 7.373,10 mensais e Reserva Técnica equivalente a 15% do valor anual da bolsa para atender a despesas imprevistas e diretamente relacionadas à atividade de pesquisa.

    Mais informações: http://www.fapesp.br/270.

    - Principais obrigações: O candidato deve ter concluído doutorado há menos de sete anos antes do início da bolsa de PD; exigência de dedicação integral ao projeto de pesquisa; o bolsista não pode ter nenhum emprego formal ou informal durante o período da bolsa. Mais informações: http://www.fapesp.br/270.

    - Inscrições: carta de interesse (com ênfase na independência, pensamento crítico e competências científicas do candidato), CV e nome de duas referências devem ser enviadas para Douglas Silva Domingues (http://tinyurl.com/dougpublications) no e-mail douglas.domingues@unesp.br.

    Opportunity to obtain a postdoctoral fellowship to work on research on the impact of climate change in the physiology and metabolism of Arabica coffee.

    The objective is to understand the effect of the interaction between high atmospheric CO2 concentration and water availability in Coffea arabica, through an ecophysiological approach, gene expression analysis and metabolite identification / quantification.

    The project that supports this fellowship will focus on:

    i) characterize the modulation of growth parameters, photosynthesis and CO2 uptake / assimilation, according to the imposed environmental conditions (Plant Ecophysiology);
    ii) investigate the modulation of C. arabica transcriptome (Plant Transcriptomics);
    iii) identify metabolites, especially polyols and secondary metabolites, modulated in leaves of C. arabica (Plant Metabolomics);
    iv) identify and associate physiological / transcript / metabolite data that may confer advantages to C. arabica metabolism in a climate change scenario (Bioinformatics).

    The project involves three institutions from the State of São Paulo: UNESP / Rio Claro, São Paulo Botanical Institute and UFABC. It also involves a close collaboration with research groups from the Instituto Superior de Agronomia, University of Lisbon, Portugal.

    Expected Profile and Skills

    The selected candidate will act on all project fronts. In this sense, it is expected that his/her PhD training covered at least one of the four areas above, with interest and willingness to receive training and subsequently conduct experiments in other areas of the project.

    However, evidence of practical work experience in woody plant ecophysiology will be considered a positive differential.

    The successful candidate will also be involved in the planning and execution of research projects and may co-advise graduate and undergraduate students. The professional should be familiar with bibliographic search tools, know how to plan and conduct experiments independently. Good command of written and spoken English is required, as well as great interest and ease in working in an interdisciplinary laboratory environment and willingness to travel regularly between the three Brazilian institutions involved in the project.

    - Period: one to three years, depending on performance.

    - Expected start: probably November / 2019

    - Benefits: This opportunity is open to candidates of any nationalities. The selected candidate will receive a FAPESP’s Post-Doctoral fellowship in the amount of BRL 7.373,10 monthly and a research contingency fund, equivalent to 15% of the annual value of the fellowship which should be spent in items directly related to the research activity. 

    More information: http://www.fapesp.br/en/5427.

    - Main obligations: The candidate must have completed a doctorate less than seven years before the beginning of the PD scholarship; requirement of full dedication to the research project; The scholar may not have any formal or informal employment during the scholarship period. More information: http://www.fapesp.br/en/5427.

    - Applications: letter of interest (with emphasis on the candidate's independence, critical thinking and scientific skills), CV and name of two references should be sent to Douglas Silva Domingues (http://tinyurl.com/dougpublications) by email to douglas.domingues@unesp.br.