Bolsa de Doutorado Direto em Genética Molecular de Leveduras

Direct Doctorate Fellowship in Yeast Molecular Genetics

Nº: 2894

Área de conhecimento: Microbiologia

Field of knowledge: Microbiology

Nº do processo FAPESP: 2017/24453-5

FAPESP process: 2017/24453-5

Título do projeto: Rede de Colaboração: Abordagens genéticas modernas para aumentar a tolerância de Leveduras a hidrolisados lignocelulósicos enriquecidos

Project title: Collaboration Network: Modern Genetic Approaches to Enhance Yeast Tolerance to Enriched Lignocellulosic Hydrolysates

Área de atuação: Genética Molecular de Leveduras

Working area: Yeast Molecular Genetics

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Pesquisador principal: Ana Paula Jacobus

Principal investigator: Ana Paula Jacobus

Unidade/Instituição: Instituto de Pesquisas em Bioenergia (IPBEN / Unesp)

Unit/Instituition: Instituto de Pesquisas em Bioenergia (IPBEN / Unesp)

Data limite para inscrições: 01/08/2019

Deadline for submissions: 2019-08-01

Publicado em: 21/05/2019

Publishing date: 2019-05-21

Localização: Rua 10, 2527, Rio Claro

Locale: Rua 10, 2527, Rio Claro

E-mail para inscrições: anapjacobus@gmail.com

E-mail for proposal submission: anapjacobus@gmail.com

  • Resumo Summary

    Uma Bolsa FAPESP de Doutorado Direto está disponível no Instituto de Pesquisas em Bioenergia (IPBEN) da Unesp em Rio Claro sob orientação da Dra. Ana Paula Jacobus (www.yeastevolution.com). A posição é financiada pela FAPESP no contexto do projeto Jovem Pesquisador “Rede de Colaboração: Abordagens genéticas modernas para aumentar a tolerância de Leveduras a hidrolisados lignocelulósicos enriquecidos”.

    Este projeto coloca a questão de como a tolerância aos inibidores de hidrolisados lignocelulósicos, utilizados na produção do etanol de segunda geração, pode ser melhorada na levedura Saccharomyces cerevisiae pelo uso de ferramentas modernas de genética molecular e biologia sintética. Para abordar esta importante questão, estabelecemos um eixo colaborativo entre os grupos pertencentes ao Instituto de Pesquisas em Bioenergia (IPBEN, Unesp), o Laboratório Brasileiro de Ciência e Tecnologia do Etanol (CTBE), Universidade de São Paulo USP) e a Universidade de Queensland, Austrália.

    Serão utilizadas abordagens experimentais tais como protocolos alternativos de evolução de laboratório adaptativo, mapeamento de loci de “quantitative traits”, sequenciamento de nova geração, competição assistida por citometria de fluxo e testes de fenotipagem, para descobrir a base genética da tolerância da levedura ao hidrolisado rico em inibidores (LCH) do bagaço de cana-de-açúcar. Desta forma, utilizando ferramentas modernas de genética molecular e a tecnologia de edição do genoma CRISPR/Cas9, será construída uma linhagem de levedura resistente à toxicidade dos hidrolisados lingnocelulósicos e adequada à produção de etanol celulósico. 

    Requisitos 

    O candidato à posição de doutorado deve ter, ou estar finalizando, graduação em áreas relacionadas a biologia, microbiologia, genética ou bioquímica. Treinamento prévio em biologia molecular é altamente desejável. Importante: como a posição é de Doutorado Direto, em adequação as regras da FAPESP (http://www.fapesp.br/278#6), o candidato deve ter graduação recém-concluída e no prazo normal, com excelente histórico escolar e, preferencialmente, estágio bem-sucedido de Iniciação Científica. Alternativamente, o candidato pode ser transferido do Mestrado para Doutorado Direto. Candidatos com Mestrado completo não poderão ser considerados.

    O aluno selecionado será matriculado no programa integrado de Doutorado em Bioenergia, oferecido conjuntamente pelas três principais universidades de São Paulo (Unesp/Unicamp/USP). Portanto, o candidato deve se adequar aos critérios formais de seleção requeridos para o ingresso no programa (http://sites.usp.br/phdbioenergy/applications/). O programa de Doutorado em Bioenergia tem orientação internacional com aulas proferidas em Inglês por videoconferência.

    Inscrição

    Inscrições devem ser enviadas à Dra. Ana Paula Jacobus (anapjacobus@gmail.com). O pacote de candidatura deve conter: 

    1- Carta de motivação (cover letter);
    2- Currículo atualizado;
    3- Lista de habilidades técnicas (i.e., o que o candidato domina de técnicas no laboratório);
    4- Nomes e e-mails de duas referências acadêmicas;
    5- Histórico escolar da graduação (preferencialmente sem reprovações). 

    Candidaturas serão aceitas e analisadas até 01/08/2019. O início da Bolsa é planejado para o segundo semestre de 2019. 

    A Direct Doctorate (PhD) scholarship funded by the São Paulo Research Foundation (FAPESP) is available at the Bioenergy Research Institute (IPBEN) affiliated with Rio Claro Biosciences Institute of São Paulo State University (IBRC-UNESP) under the mentoring of Dr. Ana Paula Jacobus (www.yeastevolution.com).

    The selected candidate will develope research in the context of the Young Researcher project “Collaboration Network: Modern Genetic Approaches to Enhance Yeast Tolerance to Enriched Lignocellulosic Hydrolysates”. This project raises the question of how tolerance to lignocellulosic hydrolysate inhibitors used in the production of second generation ethanol, can be improved in yeast Saccharomyces cerevisiae by the use of modern tools of molecular genetics and synthetic biology.

    To address this important issue, we established a collaborative axis between the groups belonging to the Bioenergy Research Institute (IPBEN, UNESP), the Brazilian Laboratory of Ethanol Science and Technology (CTBE), University of São Paulo USP) and the University of Queensland, Australia. Experimental approaches such as alternative protocols for adaptive laboratory evolution, mapping of quantitative traits, new generation sequencing, flow cytometry assisted competition and phenotyping tests will be used to discover the genetic basis of yeast tolerance to the hydrolysate rich in inhibitors (LCH) of sugarcane bagasse. Thus, using modern molecular genetic tools and the CRISPR / Cas9 genome editing technology, a yeast strain resistant to the toxicity of the lignocellulosic hydrolysates will be constructed and suitable for the production of cellulosic ethanol. 

    Requirements 

    The candidate for the Direct Doctorate position must have, or be finishing, graduation in areas related to biology, microbiology, genetics or biochemistry. In compliance with the rules of FAPESP (http://www.fapesp.br/278#6), the candidate must have a graduation recently completed and within the normal term, with an excellent academic record and, preferably, successful stage of Scientific Initiation. Alternatively, the candidate can be transferred from the MSc to PhD. Candidates with full masters cannot be considered.

    The selected student will be enrolled in the integrated Bioenergy Doctoral program offered jointly by the three main universities of São Paulo (UNESP / UNICAMP / USP). Therefore, the candidate must conform to the formal selection criteria required for joining the program (http://sites.usp.br/phdbioenergy/applications/). The PhD program in Bioenergy is internationally oriented with classes lectured in English by videoconference. 

    Subscription 

    The application should be sent to Dr. Ana Paula Jacobus (anapjacobus@gmail.com). The application package should contain: 

    1- Letter of motivation (cover letter);
    2- Updated curriculum;
    3- List of technical skills (i.e., what the candidate masters of techniques in the laboratory);
    4- Names and e-mails of two academic references;
    5- Graduation school record. 

    Applications will be accepted and analyzed until 08/01/2019. The start of the scholarship is planned for the second half of 2019.