Bolsa de JP em Bioinformática

Young Investigator Fellowship in Bioinformatics

Nº: 2492

Área de conhecimento: Biologia Geral

Field of knowledge: General biology

Nº do processo FAPESP: 2017/50334-3

FAPESP process: 2017/50334-3

Título do projeto: Plano de Desenvolvimento Institucional de Pesquisa - Instituto Biológico

Project title: Institutional Research Development Plan - Instituto Biológico

Área de atuação: Bioinformática aplicada às sanidades animal, vegetal e ambiental

Working area: Bioinformatics applied to animal, plant and environmental health

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Pesquisador principal: Ricardo Harakava

Principal investigator: Ricardo Harakava

Unidade/Instituição: Instituto Biológico

Unit/Instituition: Instituto Biológico

Data limite para inscrições: 14/12/2018

Deadline for submissions: 2018-12-14

Publicado em: 06/11/2018

Publishing date: 2018-11-06

Localização: Av. Conselheiro Rodrigues Alves, 1252, São Paulo

Locale: Av. Conselheiro Rodrigues Alves, 1252, São Paulo

E-mail para inscrições: assistente@biologico.sp.gov.br

E-mail for proposal submission: assistente@biologico.sp.gov.br

  • Resumo Summary

    O IB (Instituto Biológico) abre inscrições para candidatura de uma Bolsa Jovem Pesquisador na área de bioinformática aplicada à pesquisa em sanidade animal, vegetal e ambiental. A bolsa, com duração de 24 meses, será financiada pela Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) e vinculada ao Plano de Desenvolvimento Institucional de Pesquisa (PDIP - Processo: 2017/50334-3). O candidato selecionado receberá uma Bolsa Jovem Pesquisador da FAPESP no valor de R$ 8.377,50 e isenta de imposto de renda (http://www.fapesp.br/3162). O projeto Jovem Pesquisador selecionado será revisado por pares e poderá receber um Auxílio à Pesquisa, conforme descrito em http://www.fapesp.br/4521.

    O Instituto Biológico (IB) é um instituto de pesquisa vinculado à Secretaria de Agricultura e Abastecimento do Estado de São Paulo e tem como missão “Desenvolver e transferir conhecimento científico e tecnológico para o negócio agrícola nas áreas de sanidade animal e vegetal, suas relações com o meio ambiente, visando a melhoria da qualidade de vida da população”.

    Para assegurar o cumprimento de sua missão, foram propostas ações no PDIP do IB para o aprimoramento da capacidade de pesquisa em três áreas estratégicas: genômica aplicada às sanidades animal, vegetal e ambiental, inovação tecnológica em sanidade animal e controle biológico.

    A área de genômica deverá dar suporte para que as outras duas áreas possam obter avanços significativos do conhecimento. O desenvolvimento de novas tecnologias de sequenciamento de DNA, denominadas coletivamente de sequenciamento de nova geração ou NGS (Next Generation Sequencing), vem revolucionando os estudos nas mais diversas áreas das ciências biológicas. A obtenção de genomas completos de bactérias e fungos, estudos de expressão gênica e descoberta de novos vírus por RNAseq, filogenômica, metagenômica, e a caracterização genética de organismos de interesse econômico (sejam eles patogênicos ou agentes controladores de pragas e doenças) são algumas das aplicações de NGS que poderão aprimorar as pesquisas e a prestação de serviços do Instituto Biológico nas áreas de sanidades animal, vegetal e ambiental.

    O IB está adquirindo equipamentos de informática de alta capacidade para a realização de análises de bioinformática que darão suporte às pesquisas nas três áreas estratégicas do PDIP. Esses equipamentos serão instalados em uma Unidade Multiusuária de Bioinformática (UMB) que atenderá demandas interna e externa de pesquisa.

    Para a efetiva implementação da UMB, o IB está selecionando um JP com sólidos conhecimentos de bioinformática e experiência na aplicação de suas diversas ferramentas para a investigação de sistemas biológicos. Deseja-se que este JP tenha capacidade de interagir com diferentes grupos de pesquisa, dentro e fora do IB, no Brasil e no exterior, e versatilidade para encontrar as melhores soluções da bioinformática para possibilitar avanços significativos em suas investigações. O JP encontrará no IB ambiente científico e condições favoráveis para atingir excelência e elevada produtividade, atuando tanto em pesquisa básica como aplicada, com possibilidade de geração de novas tecnologias para o agronegócio brasileiro. As diferentes áreas de pesquisa do IB propiciam ao JP atuar na interface entre academia e o setor produtivo, gerando conhecimento com grande potencial de impacto na sociedade. 

    Pré-requisitos:

    Doutorado defendido há 10 anos ou menos em áreas correlatas à biologia molecular e bioinformática. Experiência internacional e fluência na língua inglesa. 

    Inscrição

    Os candidatos deverão submeter os documentos listados abaixo, eletronicamente (em um único PDF), para a comissão avaliadora, para o e-mail assistente@biologico.sp.gov.br, com o título “JP – Bioinformática – nome do candidato”:

    a) Súmula curricular no modelo da FAPESP (máximo de 4 páginas), conforme recomendações disponíveis em http://www.fapesp.br/5266;
    b) Três cartas de recomendação;
    c) Carta expondo como sua experiência prévia poderá contribuir para as pesquisas do IB e como pretende se aprimorar para lidar com novos desafios (até duas páginas). 

    Prazos: O candidato deverá enviar toda a documentação até 14/12/2018 e receberá um e-mail informando se foi pré-selecionado até no máximo 21/12/2018. A comissão julgadora verificará a necessidade de arguição oral dos candidatos pré-selecionados e, neste caso, as entrevistas acontecerão entre os dias 7 e 11/01/2019. A decisão final será informada até o dia 18/01/2019. O candidato selecionado deverá escrever projeto de pesquisa completo para solicitação de Auxílio à Pesquisa à FAPESP. 

    Organisation/Company: IB – Instituto Biológico (Biological Institute)

    Research Field: Agronomy, Animal and Plant Health, Biological Sciences

    Researcher Profile: Leading Researcher (R4), Established Researcher (R3)

    The IB is selecting candidates for a Young Investigator (YI) fellowship in the area of bioinformatics applied to animal, plant, and environmental health.

    IB is a research institution under direction of the São Paulo State Secretariat of Agriculture and its mission is “to develop and to transfer scientific and technological knowledge for the agricultural sector in the areas of animal and plant health, their relationships with the environment, aiming to improve the quality of life of the population”.

    Research projects that use next generation sequencing (NGS) techniques are being conducted or will be initiated by several investigators at IB. These projects involve whole genome sequencing of bacteria and fungi, RNAseq for virus discovery and gene expression analysis, phylogenomics, metagenomics, and other applications of NGS. IB is acquiring high-capacity computers to allow analysis of the data by a wide variety of bioinformatics tools.

    IB is selecting a YI with solid knowledge of bioinformatics and experience in the application of its various tools for the investigation of biological systems. It is hoped that this YI is able to interact with different research groups, inside and outside the IB, in Brazil and abroad, and have versatility to find the best bioinformatics solutions to enable significant advances in their investigations. The YI will find in the IB favorable scientific environment and conditions to achieve excellence and high productivity, acting in both basic and applied research, with the possibility of generating new technologies for Brazilian agribusiness. The different areas of research of the IB allow the YI to act in the interface between academia and the productive sector, generating knowledge with great potential of impact in society. 

    Eligibility criteria

    Doctorate obtained in 10 years or less in areas related to molecular biology and bioinformatics. International experience and fluency in English. 

    Selection process

    Candidates must submit the documents listed below, electronically (in a single PDF), to the evaluation committee, to the email assistente@biologico.sp.gov.br, under the title "YI - Bioinformatics - name of the candidate":

    a) Curriculum vitae (maximum of 4 pages);
    b) Three letters of recommendation;
    c) A letter outlining how your previous experience can contribute to IB research and how you intend to improve yourself to deal with new challenges (up to two pages).

    Deadlines: The candidate must send all documentation up to 12/14/2018 and will receive an email informing whether he/she has been pre-selected up to 12/21/2018. The judging panel will verify the need for oral argument from the pre-selected candidates and, in this case, the interviews will take place between days 7 and 11 of January 2019. The final decision will be informed until January 18th. The selected candidate should write a complete research project to request a Young Investigator Research Grant to the Sao Paulo Research Foundation -- FAPESP.