Bolsa de PD em Neuroimagem na USP

Post doctoral fellowship in Neuroimaging at USP

Nº: 979

Área de conhecimento: Medicina

Field of knowledge: Medicine

Nº do processo FAPESP: 2012/50329-6

FAPESP process: 2012/50329-6

Título do projeto: Neurociência translacional da doença de Alzheimer: Estudos pré-clínicos e clínicos do peptídeo amilóide e outros biomarcadores

Project title: Translational neuroscience of Alzheimer's disease: preclinical and clinical studies of b-amyloid peptide and other biomarkers

Área de atuação: Neuroimagem

Working area: Neuroimaging

Pesquisador principal: Geraldo Busatto Filho

Principal investigator: Geraldo Busatto Filho

Unidade/Instituição: Faculdade de Medicina / Universidade de São Paulo

Unit/Instituition: Faculdade de Medicina / Universidade de São Paulo

Data limite para inscrições: 13/12/2015

Deadline for submissions: 2015-12-13

Publicado em: 30/11/2015

Publishing date: 2015-11-30

Localização: Faculdade de Medicina, São Paulo

Locale: Faculdade de Medicina, São Paulo

  • Resumo Summary

    Busca-se profissional que tenha experiência no uso de programas computacionais para análise de dados de neuroimagem.

    Espera-se que o(a) pós-doutorando(a) trabalhe em análise de dados de conectividade funcional do cérebro humano, com processamento de dados de ressonância magnética funcional de repouso (RMf-r).

    Imagens de RMf-r de idosos cognitivamente normais e de pacientes com doença de Alzheimer (DA) e comprometimento cognitivo leve (CCL) serão pré-processadas usando o software Analysis of Functional NeuroImages (AFNI), e o processamento propriamente dito será feito utilizando programas baseados em Matlab.

    O trabalho envolverá também uso de software para avaliar a acurácia diagnóstica entre DA, CCL e idosos com cognição normal para gerar classificadores multivariados baseados em técnicas de aprendizado de máquina (support vector machine).

    Com essa descrição esperamos identificar quais são as características das conexões cerebrais críticas para a progressão clínica de cognição normal para CCL e finalmente para AD.

    O(a) profissional deverá ter conhecimentos sobre coleta e análise de dados de RMf-r e outras modalidades de neuroimagem. A capacidade do(a) bolsista em realizar, de forma autônoma, análise e organização de dados, interação com os outros pesquisadores envolvidos no projeto e elaboração de manuscritos determinará um incremento quantitativo e qualitativo na produtividade científica do Projeto Temático. 

    O(a) bolsista também terá a oportunidade de interagir com pesquisadores que se encontram na vanguarda das tecnologias de imageamento amiloide e poderá trabalhar com dados adquiridos nos mesmos indivíduos idosos usando tanto essa modalidade quanto a modalidade de RMf-r. Além disso, colocará em prática habilidades de análise de dados em um projeto desafiador e com a tarefa adicional de estabelecer pipelines otimizados para processamento de dados de RMf-r.

    Candidatos devem enviar mensagem para neuroimagem.ipq@hc.fm.usp.br, com CV e carta de recomendação.

    We are looking for a researcher with previous experience in the use of software for the analysis of neuroimaging data.

    This post-doctoral fellow will be requested to work mainly with data acquired using resting-state functional magnetic resonance imaging methods (rs-fMRI) to evaluate patterns of functional connectivity in the brain.

    In our Thematic Project, such brain imaging data is being acquired in groups of cognitively-intact elderly individuals, patients with Alzheimer's disease (AD), and patients with mild cognitive impairment (MCI).

    Pre-processing steps will be carried out using the software Analysis of Functional NeuroImages (AFNI), while the actual processing of data will be conducted using Matlab-based programs.
     
    The work will also involve use of software to evaluate the diagnostic accuracy to distinguish between AD, MCI and healthy elderlies, generating multivariate classifiers based on machine-learning methods (support vector machine). 

    With such description, we aim to identify which are the functional connectivity characteristics in the brain that are most critical for the progression from normal cognition to MCI and then to AD.
     
    The post-doctoral fellow should have knowledge about the acquisition and analysis of fMRI data and other neuroimaging modalities. We aim to bring an individual with abilities to carry out, independently, analyses and organization of computational brain imaging data, interaction with other researchers involved in the same project, and participating in the writing up of scientific papers. These characteristics are expected to boost the scientific productivity from this Thematic Project, both quantitatively and qualitatively. 

    The professional will also have the opportunity to interact with scientists who are at the forefront of technologies for amyloid imaging in the brain, and data will be combined with fMRI analyses in the same elderly subjects evaluated with those two imaging technologies.

    The post-doctoral fellow will have the opportunity to practice abilities in analysing data of a challenging scientifc project, and he/she will be expected to establish and use optimized processing pipelines for the analysis of rs-fMRI data and other neuroimaging modalities. 

    Candidates should write to neuroimagem.ipq@hc.fm.usp.br, sending CV and letter of recommendation.

    This opportunity is open to candidates of any nationalities. The selected candidate will receive a FAPESP's Post-Doctoral fellowship in the amount of R$ 6,143.40 monthly and a research contingency fund, equivalent to 15% of the annual value of the fellowship which should be spent in items directly related to the research activity.
     
    More information about the fellowship is at: www.fapesp.br/en/5427.