Bolsa de PD em Microbiologia do Solo

Post-doctoral fellowship in Soil Microbiology

Nº: 1661

Área de conhecimento: Microbiologia

Field of knowledge: Microbiology

Nº do processo FAPESP: 2016/18944-3

FAPESP process: 2016/18944-3

Título do projeto: Mudanças climáticas e eficiência energética na agricultura: um enfoque em estresse hídrico, manejo orgânico e biologia do solo

Project title: Climatic changes and energetic efficiency in agriculture: focusing on hydric stress, organic management and soil biology

Área de atuação: Microbiologia do Solo

Working area: Soil Microbiology

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Início: 11/09/2017

Start: 2017-09-11

Pesquisador principal: Elke Jurandy Bran Nogueira Cardoso

Principal investigator: Elke Jurandy Bran Nogueira Cardoso

Unidade/Instituição: ESALQ / USP

Unit/Instituition: ESALQ / USP

Data limite para inscrições: 15/08/2017

Deadline for submissions: 2017-08-15

Publicado em: 13/07/2017

Publishing date: 2017-07-13

Localização: ESALQ / USP - Av. Pádua Dias, 11, Piracicaba

Locale: ESALQ / USP - Av. Pádua Dias, 11, Piracicaba

E-mail para inscrições: ejbncard@usp.br

E-mail for proposal submission: ejbncard@usp.br

  • Resumo Summary

    Título do projeto PD: Interações entre práticas de manejo e microorganismos do solo e seus efeitos sobre a ciclagem de nutrientes do solo.

    Instituição sede: Departamento de Ciência do Solo, Escola de Agricultura "Luiz de Queiroz", Universidade de São Paulo (www.esalq.usp.br).

    Supervisor: Elke Jurandy Bran Nogueira Cardoso (Professor-sênior da ESALQ/USP).

    Escopo do projeto: Esta proposta visa estudar a estrutura da comunidade microbiana e a funcionalidade do solo envolvida nas emissões de gases de efeito estufa (GG) e também a eficiência da ciclagem de nutrientes em distintas práticas de manejo. Serão investigadas as mudanças na comunidade microbiana usando abordagens metagenômicas e de atividade enzimática do solo, além de avaliações de emissões de gases de efeito estufa nos manejos orgânico, convencional e transição do convencional para orgânico. A integração desses dados pode levar a um modelo energético mais eficiente, o que permitirá uma melhor exploração da matéria orgânica do solo. Além disso, a integração de dados com as emissões de gases contribuirá para a compreensão dos efeitos desses manejos no aquecimento global.

    Habilidades desejáveis: Por se tratar de um projeto multidisciplinar, é desejável um pós-doutor com habilidades combinadas em microbiologia e bioinformática. O pós-doutor deve apresentar familiaridade e habilidades em análises independentes de cultivo da comunidade microbiana, extração de DNA, sequenciamento, atividade enzimática do solo, bioinformática, modelagem e análises estatísticas. Também é necessário que o mesmo tenha conhecimentos consideráveis em plataformas de sequenciamento em larga escala, assim como conhecimentos em diferentes linguagens computacionais (ex: Python, Unix) e programas de análises (ex: MG-RAST, QIIME e R para análises estatísticas). Além disso, é desejável que o pesquisador tenha conhecimento de agricultura, envolvendo práticas orgânicas; no entanto, essa habilidade não é obrigatória. O pesquisador pós-doc será envolvido em expedições de campo para coletar amostras de solo e plantas e também em reuniões e conferências com os outros pesquisadores. Novos equipamentos para medidas GG serão solicitados e o pesquisador receberá treinamento apropriado em conjunto com outros alunos. Assim, conhecimento em português e inglês é desejável, visto que facilitará a interação com outros alunos que já estão trabalhando no projeto. A integração do pós-doutorado com outros pesquisadores envolvidos no projeto será necessária.

    Como candidatar-se: Os pedidos serão recebidos exclusivamente por e-mail, com a documentação anexada. As candidaturas devem ser dirigidas a Prof. Elke J. B. N. Cardoso até 15 de agosto de 2017. Para aplicação, anexe ao e-mail: i) Carta de motivação; ii) Duas cartas de referência; iii) Curriculum com artigos publicados e evidenciando as habilidades para conduzir o projeto; iv) Resumo da tese de doutorado.

    Seleção: A seleção será feita principalmente com base no currículo dos candidatos, e ainda pelo processo de entrevista pessoal (máximo de 7 candidatos selecionados para este estágio), na qual as habilidades nesses tópicos serão verificadas e outros pontos comuns serão discutidos.

    Resultado da seleção: 22 de agosto de 2017.
    Data de início: 12 de setembro de 2017 (duração de 2 anos, com possível extensão por 1 ano adicional).

    Post-doctoral project title: Interactions between crop management and soil microorganisms, and their effects on soil nutrient cycling.

    Home institution: Department of Soil Science, "Luiz de Queiroz" College of Agriculture, University of São Paulo (www.esalq.usp.br).

    Supervisor: Elke Jurandy Bran Nogueira Cardoso (Professor at ESALQ/USP).

    Project scope: This proposal aims to study the soil microbial community structure and functionality involved in greenhouse gases (GG) emissions, and also the nutrient cycling efficiency with distinct crop managements. Here, we will investigate the changes in the microbial community using metagenomic and soil enzymatic activity approaches, followed by GG emissions in organic, conventional and conventional-to-organic transition managements. The integration of such data might lead to a more efficient energetic model, which will permit a better soil organic matter conservation. Furthermore, the data integration with GG emissions will contribute to understand the effects of these managements on global warming.

    Desirable skills: Being a multidisciplinary project, it is desirable that the post-doctoral researcher presents combined skills in microbiology and bioinformatics. The post-doc researcher should have skills on culture-independent analyses of microbial communities, DNA extraction, sequencing, soil enzymatic activity, bioinformatics, modeling and statistical analyses. It is also required that the post-doc researcher already presents considerable knowledge in platforms for high-throughput sequences and expertise in different computational languages (e.g. Python, Unix) and softwares (e.g. MG-RAST, QIIME, and R for statistical analyses). Additionally, it is desirable for the post-doc researcher to have some familiarity with agriculture, especially with knowledge on organic practices, however, this skill is not mandatory. The post-doc researcher will be involved in field expeditions to collect soil and plant samples and also in meetings and conferences with other researchers. New equipment for GG measures will be applied, and the researcher will receive the appropriate training together with other students. The proficiency in Portuguese and English is required because it will facilitate the interaction with other students who are already working on the project. The integration of the post-doc with other researchers involved in the project will be necessary.

    How to apply: Applications can be made exclusively by e-mail, with the documentation attached. Applications should be directed to Prof. Elke J. B. N. Cardoso until August 15, 2017. For application, please attach to the e-mail: i) Motivation letter; ii) Two reference letters; iii) Curriculum with published articles and evidencing the abilities to conduct the project; iv) Abstract of the PhD thesis.

    Selection: The selection will be made primarily based on the curriculum of the candidates, and further by a personal interviewing process (maximum of 7 candidates selected for this stage), where the abilities in the issues will be verified and also other matters will be discussed.

    Result of selection: August 22, 2017.
    Starting date: September 12, 2017 (duration of 2 years, with possible extension for 1 additional year).

    This opportunity is open to candidates of any nationalities. The selected candidate will receive a FAPESP's Post-Doctoral fellowship in the amount of R$ 6.819,30 monthly and a research contingency fund, equivalent to 15% of the annual value of the fellowship which should be spent in items directly related to the research activity.

    More information about the fellowship is at: www.fapesp.br/en/5427.