Bolsa de JP em Ciências de Dados em Saúde

Young Investigator Fellowship in Health Data Science

Nº: 2999

Área de conhecimento: Ciência da Computação

Field of knowledge: Computer science

Nº do processo FAPESP: 2017/50342-6

FAPESP process: 2017/50342-6

Título do projeto: Modernização da infraestrutura de pesquisa do Instituto Dante Pazzanese de Cardiologia para a inovação em prevenção, diagnóstico e tratamento de doenças cardiovasculares

Project title: Modernization of the research infrastructure of the Dante Pazzanese Institute of Cardiology for innovation in the prevention, diagnosis and treatment of cardiovascular diseases

Área de atuação: Ciências de Dados Aplicadas a Cardiologia

Working area: Data Science Applied to Cardiology

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Pesquisador principal: Fausto Feres

Principal investigator: Fausto Feres

Unidade/Instituição: Instituto Dante Pazzanese de Cardiologia

Unit/Instituition: Instituto Dante Pazzanese de Cardiologia

Data limite para inscrições: 15/09/2019

Deadline for submissions: 2019-09-15

Publicado em: 12/07/2019

Publishing date: 2019-07-12

Localização: Av. Dr. Dante Pazzanese, 500, Vila Mariana, São Paulo

Locale: Av. Dr. Dante Pazzanese, 500, Vila Mariana, São Paulo

E-mail para inscrições: eap@idpc.org.br

E-mail for proposal submission: eap@idpc.org.br

  • Resumo Summary

    O Instituto Dante Pazzanese de Cardiologia (IDPC) abre inscrições para seleção de candidatos a uma Bolsa de Jovem Pesquisador (JP) na área de investigação de Ciência de Dados em Saúde. O JP deverá desenvolver projeto de pesquisa para ampliação da atuação do Instituto em medicina 4.0.

    A bolsa de JP terá duração inicial de 24 meses, passível de prorrogação por até mais 24 meses. Esta bolsa está vinculada ao Plano de Desenvolvimento Institucional em Pesquisa do IDPC (PDIP - processo nº 2017/50342-6) e será financiada pela FAPESP. O candidato selecionado receberá uma Bolsa Jovem Pesquisador FAPESP no valor de R$ 8.377,50 mensais e isenta de imposto de renda. Adicionalmente, após a análise da FAPESP, o projeto Jovem Pesquisador selecionado poderá receber um Auxílio JP que deverá ter duração de até 60 meses, conforme descrito em www.fapesp.br/4521

    Descrição do Instituto

    O Instituto Dante Pazzanese de Cardiologia tem por finalidade a prestação de assistência médico-hospitalar, em regime ambulatorial, de emergência e de internação na área cardiovascular, visando a promoção de saúde, a proteção contra doenças cardiovasculares e ao diagnóstico, tratamento e reabilitação da população portadora dessa patologia. Promove também a investigação e pesquisa na área cardiovascular, incluindo o desenvolvimento de novas tecnologias, equipamentos, procedimentos, práticas e drogas. Tem também como objetivo a promoção de ensino para todas as categorias que atuam na área de cardiologia e de interesse em saúde pública. 

    Sobre a vaga

    O JP deverá desenvolver projeto de pesquisa para ampliação da atuação do instituto na área de Ciência de Dados visando o estabelecimento de competência e infraestrutura para estudo de dados em pesquisa clínica e laboratorial para diagnóstico, prevenção e tratamento de doenças cardiovasculares.

    Para isso, é necessário o desenvolvimento de modelos em Machine Learning (ML), utilizando técnicas como regressão, classificação, redes neurais e Deep Learning; realização de pesquisas em diversas fontes de dados que são produzidos no instituto, tais como dados clínicos e laboratoriais; implementação e validação de modelos preditivos; criação de modelos estatísticos com foco em Big Data; compreensão e trabalho com processo de ETL; análise e identificação de tendências e comportamentos com o uso de estatística; acompanhamento do desempenho dos modelos de Machine Learning nas diversas áreas de pesquisa institucional; e conhecimentos em ferramentas de BI.

    O JP deverá trabalhar com programação em Python, R e Matlab, banco de dados SQL (PostgreSQL, MySQL) e NoSQL (MongoDB, CouchDB).

    O candidato deverá desenvolver um projeto relacionado ao tema proposto, auxiliar na orientação e co-orientação de alunos, colaborar no desenvolvimento de projetos na instituição sede, auxiliar na redação e revisão de trabalhos científicos da instituição e em ações que visem transferência de tecnologia e conhecimento. 

    Experiência requerida

    Recomenda-se que o jovem pesquisador tenha conhecimentos sólidos em: linguagens de manipulação de dados, como SQL, Python, R, dentre outras; estatística e fundamentos de Machine Learning, Deep Learning, plataforma Hadoop, lógica fuzzy e IoT; conhecimentos em ferramentas de BI, preferencialmente no Tableau; conhecimentos em Alteryx; conhecimento de Text Analytics em banco de dados SQL (PostgreSQL, MySQL) e NoSQL (MongoDB, CouchDB); e desenvolvimento de mecanismos de controle e qualidade. 

    Pré-requisitos da vaga

    Para a vaga é necessário que o candidato preencha os seguintes pré-requisitos:

    • Possuir doutorado em Engenharias, Ciência da Computação, Estatística, Matemática aplicada ou áreas afins;
    • Experiência em desenvolvimento de projeto de pesquisa no exterior em grupo de pesquisa internacionalmente competitivo (mínimo de 2 anos);
    • Experiência prática comprovada nas técnicas acima descritas;
    • Habilidade em trabalhar de forma independente e em colaboração com grupo de pesquisa multidisciplinar;
    • Conhecimento da língua inglesa para leitura, redação científica e conversação;
    • Apresentar produção científica de alto impacto na área do projeto proposto. 

    Inscrição

    Os documentos listados a seguir deverão ser enviados eletronicamente (em um único PDF) para a comissão avaliadora, para os e-mails eap@idpc.org.br e nit@idpc.org.br, com o título “Jovem Pesquisador – Ciência de Dados em Saúde”: 

    a) Súmula curricular no modelo da FAPESP (máximo de 4 páginas), conforme recomendações disponíveis em http://www.fapesp.br/5266;
    b) Carta de motivação evidenciando sua aderência aos pré-requisitos exigidos (máximo de 200 palavras);
    c) Proposta de pesquisa relevante para o tema proposto (máximo de 300 palavras);
    d) Documentos que comprovem a experiência exigida nos tópicos acima. 

    Qualquer dúvida ou esclarecimento sobre o edital, entrar em contato através dos e-mails citados. 

    A data limite para as inscrições é 15 de setembro de 2019. 

    Processo de seleção

    O processo de seleção será dividido em duas etapas:

    Primeira: processo seletivo realizado pelo IDPC. Nesta etapa serão analisados, pela comissão avaliadora, o currículo dos candidatos, com experiência comprovada nos requisitos descritos, e a proposta de pesquisa apresentada. O candidato receberá um e-mail informando se foi pré-selecionado até 30/09/2019.

    Segunda: Dois candidatos pré-selecionados deverão submeter seus projetos de pesquisa completos para os e-mails eap@idpc.org.br e nit@idpc.org.br para análise da comissão avaliadora do IDPC. O projeto melhor avaliado, pela comissão, será encaminhado como Auxílio JP à FAPESP e entrará no mesmo sistema de análise das propostas recebidas em fluxo contínuo. A concessão da bolsa JP está condicionada à aprovação do Auxílio JP pela FAPESP e a decisão final será publicada em http://www.idpc.org.br.

    Cabe salientar, que a aprovação do candidato no processo seletivo realizado pelo IDPC não garante a concessão do Auxílio JP pela FAPESP. 

    The Instituto Dante Pazzanese de Cardiologia (IDPC) opens applications for the selection of candidates for a Young Investigator (YI) fellowship in Health Data Science. The YI will develop a research project to expand the institute’s practice in medicine 4.0.

    The YI grant will have an initial duration of 24 months, which may be extended for up to another 24 months. This grant is linked to the IDPC Institucional Research Development Plan (PDIP – grant number 2017 / 50342-6) and will be funded by the São Paulo Research Foundation (FAPESP). The selected candidate will receive a Young Investigator Fellowship from FAPESP in the amount of BRL8,377.50 per month exempt from income tax. In addition, after FAPESP analysis, the selected Young Researcher project may receive a YI Grant that should last up to 60 months, as described in www.fapesp.br/en/6251.

    Description of the Hospital

    The purpose of the Instituto Dante Pazzanese de Cardiologia is to provide medical and hospital care, on an outpatient, emergency and inpatient basis in the cardiovascular area, aiming at health promotion and cardiovascular diseases prevention, diagnosis, treatment and rehabilitation. It also promotes cardiovascular research, including the development of new technologies, medical devices, procedures, medical practices and drugs. It also aims to provide quality education for medical professionals in the cardiology and public health fields.

    Job vacancy description

    The YI should develop a research to expand the institute’s performance in the area of Data Science aiming to establish competence and infrastructure for data study in clinical and laboratory research for diagnosis, prevention and treatment of cardiovascular diseases.

    For this, the fellow must develop models in Machine Learning (ML), using techniques such as regression, classification, neural networks and Deep Learning; conduct research on various data sources that are produced at the institute, such as clinical and laboratory data; implement and validate predictive models; create statistical models focused on Big Data; understand and work with ETL process; analyze and identify trends and behaviors with the use of statistics; monitor the performance of Machine Learning models in the various areas of institutional research; and have knowledge of BI tools.

    The YI should work with programming in Python, R and Matlab, SQL database (PostgreSQL, MySQL) and NoSQL (MongoDB, CouchDB).

    The candidate must develop a project related to the proposed theme. Also, assist in the orientation and co-orientation of medical students, cooperate in the development of new projects at the hospital, assist in the writing and review of scientific protocols, and in all necessary actions for knowledge and technology transfer.

    Required previous experience

    It is recommended that the YI has solid knowledge in:

    • Data manipulation language, such as SQL, Python, R, among others;
    • Statistics and Fundamentals of Machine Learning, Deep Learning, Hadoop platform, fuzzy logic and IoT;
    • Knowledge in BI tools, preferably Tableau;
    • Knowledge in Alteryx;
    • Text Analytics SQL database (PostgreSQL, MySQL) and NoSQL (MongoDB, CouchDB);
    • Development of control and quality mechanisms.

    Job requirements

    The candidate must have skill and qualification in:

    • Doctorate in Engineering, Computer Science, Statistics, Applied Mathematics or related fields;
    • Experience in the development of a research project abroad in an internationally competitive research group (minimum of 2 years);
    • Proven practical experience in the techniques described above;
    • Ability to work independently and in collaboration with a multidisciplinary research group;
    • Knowledge of the English language for reading, scientific writing and conversation;
    • Present high impact scientific production in the proposed project area.

    Application

    The documents listed below should be sent electronically (in a single PDF) for evaluating committee throught the e-mails eap@idpc.org.br and nit@idpc.org.br, under the title “Young Researcher – Health Data Science”:

    a) Curricular summary (maximum of 4 pages), according to the recommendations available at FAPESP´s site: http://www.fapesp.br/en/6351;
    b) Letter of motivation showing its adherence to the described requirements (maximum of 200 words);
    c) Research proposal relevant to the proposed theme (maximum of 300 words);
    d) Documents proving the experience required in the above topics.

    Any questions or clarifications regarding this opportunity announcement, contact us through the e-mails mentioned.

    The deadline for submission is September 15, 2019.

    Selection process

    The selection process is divided into two steps:

    First: the selection process carried out by IDPC. At this stage, the evaluation committee will analyze the candidates' curriculum, with proven experience in the requirements described, and the research proposal presented.

    The candidate will receive an email informing them if they have been pre-selected by 9/30/2019.

    Second: Two pre-selected candidates must submit their full research projects to the e-mails eap@idpc.org.br and nit@idpc.org.br for review by the IDPC evaluation committee. The best evaluated project, by the commission, will be sent as YI Grant to FAPESP and will be included in FAPESP’s system of open deadline applications analysis. The grant is conditional to the approval of the YI Grant by FAPESP and the final decision will be published at http://www.idpc.org.br.

    It should be noted that the approval of the candidate in the selection process carried out by IDPC does not guarantee the granting of the YI Grant by FAPESP.