Bolsa de JP em Virologia

Young Investigator Fellowship in Virology

Nº: 2731

Área de conhecimento: Microbiologia

Field of knowledge: Microbiology

Nº do processo FAPESP: 2017/50333-7

FAPESP process: 2017/50333-7

Título do projeto: Metagenômica na detecção e descrição de vírus de interesse em Saúde Pública.

Project title: Metagenomics in the detection and description of viruses of interest in public health.

Área de atuação: Virologia

Working area: Virology

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Pesquisador principal: Helio Hehl Caiaffa Filho

Principal investigator: Helio Hehl Caiaffa Filho

Unidade/Instituição: Centro de Virologia/Instituto Adolfo Lutz

Unit/Instituition: Centro de Virologia/Instituto Adolfo Lutz

Data limite para inscrições: 19/06/2019

Deadline for submissions: 2019-06-19

Publicado em: 19/03/2019

Publishing date: 2019-03-19

Localização: Avenida Dr. Arnaldo, 355, São Paulo

Locale: Avenida Dr. Arnaldo, 355, São Paulo

E-mail para inscrições: maria.timenetsky@ial.sp.gov.br

E-mail for proposal submission: maria.timenetsky@ial.sp.gov.br

  • Resumo Summary

    A oportunidade é para o desenvolvimento de projeto para implantação da área de Metagenômica Viral dentro do Plano de Desenvolvimento Institucional de Pesquisa (PDIP) com metodologias para a detecção e descrição de vírus de interesse em Saúde Pública.

    A proposta visa desenvolver soluções científicas e tecnológicas que propiciem respostas rápidas para o fortalecimento das ações laboratoriais de Vigilância em Saúde. Para isso, abordará importantes conceitos usados em Metagenômica como:

    • Base de dados Biológicos (Biological Databases);
    • Sequenciamento de Nova Geração (NGS sequency);
    • Análises de sequências (Deep sequencing and sequency analyses);
    • Teoria de Redes (Network Theory). 

    O projeto será financiado pela FAPESP através do Programa de Bolsas Jovem Pesquisador (www.fapesp.br/4521). O candidato selecionado receberá uma bolsa de pesquisa no valor de R$ 8,377.50 mensais livre de taxas, com duração máxima de 48 meses. O projeto revisado do Jovem Pesquisador selecionado pode receber subsídio de pesquisa como previsto em www.fapesp.br/4521.

    Descrição do instituto

    O Instituto Adolfo Lutz é um instituto de pesquisa do Estado de São Paulo. Com mias de 100 anos, ele foi criado para enfrentar emergências sanitárias associadas às grandes ondas migratórias no início do século XX. Com 12 unidades regionais, promove atividades laboratoriais para o Sistema Público de Saúde no Brasil. O Centro de Virologia (CV) desenvolve atividades especializadas visando a detecção e a caracterização de patógenos emergentes e reemergentes, participando de redes nacionais e internacionais.

    Pré-requisitos para a posição

    Experiência prévia em sequenciamento completo abordando preparação de matrizes de ácidos nucleicos, análises de dados, metagenômica viral, descoberta de novos vírus, EERC, etc, é um fator determinante no processo de seleção.

    O foco da pesquisa é o desenvolvimento de metodologias para o monitoramento indireto de patógenos para rápida detecção de infecções emergentes ou potencialmente emergentes, com o emprego de métodos de deep sequencing e análises de sequências. A posição necessitará de trabalhos colaborativos com grupos de pesquisa do CV e de outros grupos das áreas de epidemiologia e entomologia. 

    Perfil e habilidades necessárias

    Doutorado em Biologia Molecular com Pós-Doutorado internacional em Metagenômica Viral. Experiência na área comprovada por publicações nos últimos 5 anos. Domínio nos Idiomas: inglês e português.

    Aplicação, documentos e datas

    Enviar inscrição eletronicamente, incluindo uma carta de motivação (200 LINHAS no máximo), Curriculum Vitae (04 páginas no máximo) e três cartas de recomendação para maria.timenetsky@ial.sp.gov.br. A data limite para inscrição é 90 dias a partir da publicação da vaga. Os candidatos devem enviar seu curriculo (em .pdf) demonstrando sua experiência e destacando suas publicações em revistas científicas, indexadas de acordo com as instruções da FAPESP (breve Instruções CV FAPESP - http://www.fapesp.br/5266). O candidato também deve incluir uma proposta resumida de pesquisa (300 palavras no máximo) relevante para a área de interesse para esta posição. Enviar TODAS as informações como arquivo .pdf ÚNICO.

    O curriculo dos candidatos, com experiência comprovada nos tópicos descritos acima, e a proposta de pesquisa apresentada são elementos-chave no processo de seleção. O candidato receberá um e-mail da Dra. Maria do Carmo S. T. Timenetsky informando se ele/ela foi pré-selecionado(a) para esta posição. Os candidatos pré-selecionados serão convidados a submeter um projeto de pesquisa completo usando o e-mail no mesmo link e a decisão final será publicada pelo Instituto Adolfo Lutz no site http://www.ial.sp.gov.br

    The Adolfo Lutz Institute in São Paulo, Brazil, is looking for a passionate and dedicated young investigator interested in Vital Metagenomics methodology to detect and describe viruses of Public Health interest.

    The fellow is expected to develop research on non-directed monitoring of pathogens for early detection of emerging viral infections or those with the potential to emerge. More specifically, he/she will initially be asked to describe the viral metagenomics including pathogenic agents of human and mosquitoes by applying methods of deep sequencing and sequence analyses via adapted algorithms. As the position requires collaborative work with members of the virology group and interdisciplinary collaboration with other groups (epidemiology and entomology), the ability to interact with others across scientific cultures will be important.

    The research will focus in important concepts used in Metagenomics, such as:

    • Biological Databases;
    • NGS sequency;
    • Deep sequencing and sequency analyses;
    • Network Theory.

    The project will be funded by the São Paulo Research Foundation - FAPESP (www.fapesp.br/en), through its Young Investigator Award Program (www.fapesp.br/en/4479). The award will be provided as a Reseasrch Grant with the maximum duration of 48 months. The selected candidate will receive a FAPESP Young Investigator Fellowship, in the amount of R$ 8,377.50 monthly free of Income Taxes. The peer reviewed project of the selected Young Investigator may receive a Research Grant as described in www.fapesp.br/en/4479.

    Description of the institute

    The Adolfo Lutz Institute is a research institute of the State of São Paulo. With over 100 over years, it was created to cope with the sanitary emergencies associated with the large migratory flow early in the 20th century. With 12 regional units, also provides laboratory support to the Brazilian system. The Virology Center (VC) peforms specialized and differentiated laboratory activities in order to detect and characterize emerging threats as well as relevant epidemics and epidemic agents, participating in local and international networks. 

    Prerequisites for the position

    Expertize on molecular methods in virology (detection, NGS sequencing, NGS sequence analysis, virus discovery, etc.).

    Previous successful experience in massive parallel sequencing approaches with a priori knowledge (preparation of nucleic acid matrices, massive sequencing data analyses, viral metagenomics, virus discovery, EERC etc.) is a determining factor of the selection process.

    Your profile and required skills

    PhD in Virology or Viral Metagenomics with Post-Doctoral experience in the subject matter supported by publications in the last five years. Experience in Metagenomics and Bioinformatics tools. Language skills: English and Portuguese.

    Application, documents and dates

    Please submit your application electronically, including a motivation letter (200 Words MAX), curriculum vitae (04 pages MAX) and three recommendation letters file to maria.timenetsky@ial.sp.gov.br. The deadline for applications is 90 days from the publication of the vacancy. The applicants should send their résumé (in pdf) showing his/her experience and highlighting his/her publications in indexed scientific journals according to FAPESP instructions (short CV FAPESP Instructions - http://www.fapesp.br/en/6351). The application should also include a short (300 words MAX) research proposal relevant to this position. Please send ALL the information as a SINGLE .pdf file.

    The candidates' curriculum, with proven experience on the topics described above and the submitted research proposal are key elements in the selection process. The candidate will receive an e-mail informing if he/she preselected for this position by Dr. Maria do Carmo S. T. Timenetsky. The pre-selected candidates will be asked to submit a full research Project by the e-mail address under the same application link and the final decision will be posted at Adolfo Lutz Institute's website (http://www.ial.sp.gov.br).