Bolsa de PD em Genética Mitocondrial

Post-doctoral Fellowship in Mitochondrial Genomic

Nº: 2360

Área de conhecimento: Medicina

Field of knowledge: Medicine

Nº do processo FAPESP: 2017/04372-0

FAPESP process: 2017/04372-0

Título do projeto: Genética mitocondrial dos tumores renais

Project title: Mitochondrial genomic of renal tumors

Área de atuação: Genética Mitocondrial

Working area: Mitochondrial Genomic

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Pesquisador principal: Rodolfo Borges dos Reis

Principal investigator: Rodolfo Borges dos Reis

Unidade/Instituição: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto - USP

Unit/Instituition: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto - USP

Data limite para inscrições: 25/10/2018

Deadline for submissions: 2018-10-25

Publicado em: 25/09/2018

Publishing date: 2018-09-25

Localização: Avenida Bandeirantes 3900, Hospital das Clínicas da FMRP-USP, 10 andar, Departamento de Cirurgia e Anatomia, Ribeirão Preto

Locale: Avenida Bandeirantes 3900, Hospital das Clínicas da FMRP-USP, 10 andar, Departamento de Cirurgia e Anatomia, Ribeirão Preto

E-mail para inscrições: rodolforeis@fmrp.usp.br

E-mail for proposal submission: rodolforeis@fmrp.usp.br

  • Resumo Summary

    Uma posição de pós-doutor com bolsa FAPESP está disponível no Laboratório de ensaios moleculares em Uro-Oncologia do Professor Rodolfo Borges dos Reis, do Departamento de Cirurgia e Anatomia da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, SP, Brasil.

    O candidato deve possuir título de doutor em Ciências. Habilidades de relacionamento interpessoal, comunicação oral e escrita, habilidade analítica, criatividade e iniciativa são requisitos fundamentais. O subprojeto vinculado à referida vaga tem como objetivo principal avaliar a heterogeneidade do genoma mitocondrial em mitocôndrias extraídas de amostras de carcinoma renal de células claras.

    As mitocôndrias serão isoladas dos tecidos tumorais para evitar a contaminação de pseudogenes mitocondriais presentes no DNA nuclear. Os parâmetros avaliados incluem a ocorrência de depleção do DNA mitocondrial por meio da determinação do número de cópias por qPCR; avaliação da ocorrência de grandes rearranjos do genoma DNA (deleções) únicas ou múltiplas; além do sequenciamento completo do genoma mitocondrial em ferramentas de sequenciamento genômico em larga escala (NGS). 

    Requesitos

    O candidato deve ter o título de Doutor em Ciências com ênfase em urologia, ou Disciplina correlata (o título não pode ter sido obtido há mais de dois anos da data limite para inscrição).Conhecimento em anatomia renal, experiência de métodos relevantes para realizações de técnicas de sequenciamento de nova geração para realização de isolamento e extração do genoma mitocondrial, PCR em tempo real (qPCR), PCR convencional, experiência com preparo de biblioteca de NGS para Ion Torrent PGM e manuseio de dados de bioinformática do genoma mitocondrial (serão considerados fortes diferenciais). Além disso, o candidato deve ter experiência prévia em coleta, transporte, e armazenamento de material biológico humano obtido durante o ato cirúrgico.

    Inscrição

    Para a inscrição, o candidato deve enviar, até 25 de outubro de 2018, ao e-mail do Professor Rodolfo Borges dos Reis, rodolforeis@fmrp.usp.br [Departamento de Cirurgia e Anatomia, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Avenida Bandeirantes 3900, 14049-900, Ribeirão Preto, SP, Brasil], o Curriculum Vitae, três nomes ou cartas de referências que possam emitir juízo sobre o perfil do próprio candidato, cópia do título de doutor, ou declaração com a data em que a tese foi defendida. 

    A postdoctoral position is available at the Laboratory of Uro-Oncology directed by Professor Rodolfo Borges dos Reis, Department of Surgery and Anatomy, Ribeirão Preto Medical School, University of São Paulo, Ribeirão Preto, SP, Brazil.

    The candidate must hold a Ph.D. Interpersonal skills, oral and written communication, analytical skills, creativity and initiative are essential requirements. The objective of the project to be conducted involves evaluation of the heterogeneity of the mitochondrial genome of mitochondria extracted from clear cell renal carcinoma.

    Mitochondria will be isolated from tumoral tissues to avoid contamination of mitochondrial pseudogenes present in the nuclear DNA. The parameters to be evaluated involve mitochondrial DNA depletion,taking into account the determination of copynumber by the qPCR; and also the evaluation of the rearrangements (deletions) and the complete sequencing of the mitochondrial genome in large-scale genomic (NGS).

    Profile

    The candidate must hold a Ph.D title with emphasis in urology, or related Disciplines (the Ph.D title cannot have been obtained more than two years from the application deadline). It is emphasized that knowledge of renal anatomy and histology are required, besides the experience with techniques relevant to the proposal of new generation sequencing tools for conducting mitochondrial genome isolation and extraction;experience with real-time PCR (qPCR), conventional PCR, NGS library preparation for Ion Torrent PGM and manipulation of bioinformatics data of the mitochondrial genome (will be considered strong differentials) are also required as well. In addition, the candidate must have previous experience for collecting, transporting and storing human biological material obtained from surgery. 

    How to Apply

    The candidate must apply before October 25th, 2018. The documents required are the following: Curriculum Vitae; three names or letters of references; copy of the Ph. D degree or a statement of the date when the Ph.D. title was obtained, to the e-mail of Professor Rodolfo Borges dos Reis, M.D., Ph.D. (rodolforeis@fmrp.usp.br) [Department of Surgery and Anatomy, Ribeirão Preto Medical School, 3900. BandeirantesAvenue, 14049-900, Ribeirão Preto, SP, Brazil].

    This opportunity is open to candidates of any nationalities. The selected candidate will receive a São Paulo Research Foundation-FAPESP’s Post-Doctoral fellowship in the amount of BRL 7.373,10 monthly and a research contingency fund, equivalent to 15% of the annual value of the fellowship which should be spent in items directly related to the research activity.