Bolsa de TT-III em Genética Molecular

Level 3-Technical Training Fellowship in Molecular Genetics

Nº: 3051

Área de conhecimento: Genética

Field of knowledge: Genetics

Nº do processo FAPESP: 2018/08416-5

FAPESP process: 2018/08416-5

Título do projeto: Estudo de associação genômica ampla de baixo custo e predições genômicas para resistência a Aeromonas hydrophila em pacu (Piaractus mesopotamicus)

Project title: Low-cost genome-wide association study and genomic predictions for resistance to Aeromonas hydrophila in pacu (Piaractus mesopotamicus)

Área de atuação: Genética Molecular

Working area: Molecular Genetics

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Pesquisador principal: Diogo Teruo Hashimoto

Principal investigator: Diogo Teruo Hashimoto

Unidade/Instituição: Centro de Aquicultura / UNESP

Unit/Instituition: Centro de Aquicultura / UNESP

Data limite para inscrições: 23/08/2019

Deadline for submissions: 2019-08-23

Publicado em: 30/07/2019

Publishing date: 2019-07-30

Localização: Via de Acesso Prof. Paulo Donato Castellane, s/n, Jaboticabal

Locale: Via de Acesso Prof. Paulo Donato Castellane, s/n, Jaboticabal

E-mail para inscrições: diogo.hashimoto@unesp.br

E-mail for proposal submission: diogo.hashimoto@unesp.br

  • Resumo Summary

    O Laboratório de Genética em Aquicultura e Conservação (LaGeAC) do Centro de Aquicultura da Unesp de Jaboticabal está com uma oportunidade aberta para Treinamento Técnico nível III, com Bolsa FAPESP, no âmbito do Projeto da Chamada Internacional FAPESP-CONICYT 2018 “Estudo de associação genômica ampla de baixo custo e predições genômicas para resistência a Aeromonas hydrophila em pacu (Piaractus mesopotamicus)” (Processo FAPESP nº 2018/08416-5), sob a coordenação do Prof. Dr. Diogo Teruo Hashimoto. 

    A seleção de genótipos superiores para resistência a doenças é uma abordagem fundamental para maximizar a produção no contexto da sustentabilidade ambiental e segurança alimentar. Os objetivos deste projeto são: i) realizar um estudo de associação genômica ampla para resistência a Aeromonas hydrophila em pacu e ii) avaliar estratégias de predição genômica utilizando uma estratégia de baixo custo com base na combinação de genotipagem-por-sequenciamento (GBS), baixa densidade de polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) e imputação de genótipos. 

    Tarefas:

    • Preparação de soluções;
    • Identificação de amostras e armazenamento;
    • Rotina, manutenção e limpeza da área de trabalho;
    • Elaboração de Procedimento Operacional Padrão (POP);
    • Realização de experimentos;
    • Extração de DNA e RNA;
    • Eletroforese em gel de agarose;
    • Quantificação de DNA e RNA;
    • Análises estatísticas;
    • Análises genômicas com programas de bioinformática;
    • Colaboração com outras equipes multi-disciplinares do laboratório.

    *Alguma outra tarefa associada ao projeto pode vir a ser requerida de tempo em tempo. 

    Qualificações:

    • Graduação concluída ou prestes a concluir;
    • Conhecimento básico em genética molecular;
    • Conhecimento em Microsoft Office (Word, Excel e PowerPoint);
    • Habilidade de trabalhar como parte de uma equipe;
    • Comprometimento, organização, precisão e manutenção do registro de dados;
    • Experiência prévia em laboratório de pesquisa ou rotina;
    • Experiência com preparação de soluções.

    Interessados, por favor, enviar um e-mail contendo os seguintes documentos para diogo.hashimoto@unesp.br:

    1. Currículo;
    2. Histórico da Graduação.

    As bolsas terão duração de 12 meses, prorrogáveis por até 12 meses, a depender do desempenho do bolsista, o qual será avaliado de acordo com as normas da FAPESP. O candidato selecionado receberá Bolsa de Treinamento Técnico III (TT-3) da FAPESP no valor de R$ 1.228,40 mensais. 

    The Laboratory of Genetics in Aquaculture and Conservation (LaGeAC), from the São Paulo State University – UNESP’s Aquaculture Center located in Jaboticabal, Brazil, has an open opportunity for Technical Training (Level III) with Scholarship funded by the São Paulo Research Foundation (FAPESP). The selected candidate will work within the Project “Low-cost genome-wide association study and genomic predictions for resistance to Aeromonas hydrophila in pacu (Piaractus mesopotamicus)” (grant number 2018 / 08416-5), stablished through the 2018 International Call between FAPESP and CONICYT, the Chilean government ST&I agency. Professor Dr. Diogo Teruo Hashimoto is project supervisor. 

    Selecting superior genotypes for disease resistance is a key approach to maximizing production in the context of environmental sustainability and food safety. The objectives of this project are: i) to perform a genome-wide association study for Aeromonas hydrophila resistance in pacu and ii) to evaluate genomic prediction strategies using low cost genotyping-sequencing (GBS), low density of single nucleotide polymorphisms (SNPs) and genotype imputation. 

    Tasks:

    • Preparation of solutions;
    • Identification of samples and storage;
    • Routine, maintenance and cleaning of the work area;
    • Preparation of Standard Operating Procedure;
    • Conducting experiments;
    • DNA and RNA extraction;
    • Agarose gel electrophoresis;
    • DNA and RNA quantification;
    • Statistical analysis;
    • Genomic analysis with bioinformatics programs;
    • Collaboration with other multi-disciplinary lab teams.

    * Some other task associated with the project may be required from time to time. 

    Qualifications:

    • Graduation completed or near to complete;
    • Basic knowledge in molecular genetics;
    • Knowledge in Microsoft Office (Word, Excel and PowerPoint);
    • Ability to work as part of a team;
    • Commitment, organization, accuracy and maintenance of data records;
    • Previous experience in research laboratory or routine;
    • Experience with preparing solutions.

    Interested candidates, please send an email containing the following documents to diogo.hashimoto@unesp.br:

    1. Curriculum;
    2. History of Graduation.

    The scholarship will be applied in the period of 12 months, renewable for up to 12 months, depending on the performance of the candidate, which will be evaluated according to FAPESP rules. The selected candidate will receive FAPESP Technical Training Grant III (TT-3), in the amount of R$ 1,228.40 per month.