Bolsa de PD em Bioquímica

Post-doctoral Fellowship in Biochemistry

Nº: 2833

Área de conhecimento: Bioquímica

Field of knowledge: Biochemistry

Nº do processo FAPESP: 2017/17303-7

FAPESP process: 2017/17303-7

Título do projeto: Estrutura e Função de Sistemas de Secreção Bacterianas

Project title: Structure and Function of Bacterial Secretion Systems

Área de atuação: Bioquímica, Biologia Estrutural, Microbiologia Molecular

Working area: Biochemistry, Structural Biology, Molecular Microbiology

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Início: 01/07/2019

Start: 2019-07-01

Pesquisador principal: Shaker Chuck Farah

Principal investigator: Shaker Chuck Farah

Unidade/Instituição: Instituto de Química, USP

Unit/Instituition: Instituto de Química, USP

Data limite para inscrições: 02/06/2019

Deadline for submissions: 2019-06-02

Publicado em: 25/04/2019

Publishing date: 2019-04-25

Localização: Av. Prof. Lineu Prestes, 748, São Paulo

Locale: Av. Prof. Lineu Prestes, 748, São Paulo

E-mail para inscrições: chsfarah@iq.usp.br

E-mail for proposal submission: chsfarah@iq.usp.br

  • Resumo Summary

    Estão abertas inscrições para uma vaga de Pós-doutor em Microbiologia Molecular e Biologia Estrutural junto ao grupo do Shaker Chuck Farah do Departamento de Bioquímica no Instituto de Química da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brasil. 

    A bolsa tem valor de R$ 7.373,10 / mês e duração de até 24 meses, renovável por mais dois períodos de 12 meses. Também prevê Reserva Técnica equivalente a 15% do valor anual da bolsa para atender a despesas imprevistas e diretamente relacionadas à atividade de pesquisa. 

    O foco geral da nossa pesquisa é entender a relação estrutura-função no nível molecular de sistemas bacterianos de secreção de macromoléculas. 

    O projeto daria oportunidades a jovens cientistas investigar a estrutura e o funcionamento do pilus do tipo IV (T4P) do fitopatôgeno Xanthomonas citri, envolvido em motilidade bacteriana e a formação de biofilmes. Especificamente, planejamos: i) estudar as interações (in vivo e in vitro) envolvendo PilB, PilM e PilC associados com a membrana interna e os reguladores PilZ e FimX; ii) estudar as estruturas de complexos envolvendo PilB, PilM, PilC, PilZ e FimX empregando técnicas de cristalografia, RMN e/ou criomicroscopia eletrônica; iii) isolar filamentos extracelulares do T4P (polímeros de PilA) e estudar suas interações com o bacteriófago φXacm4-11 que infecta X. citri, e iv) empregar a técnica de criomicroscopia eletrônica para determinar a estrutura do bacteriófago φXacm4-11 isolado e em complexo com o T4P. 

    A vaga é destinada a jovens cientistas com título de doutor em Bioquímica, Química, Biologia, Física, Biomedicina, Farmácia ou áreas relacionadas, com experiência em técnicas de biologia molecular, expressão e purificação de proteínas recombinantes e um interesse em estudar a relação estrutura molecular/função em sistemas biológicos. Experiência prévia em técnicas de biologia estrutural (cristalografia, RMN, microscopia eletrônica, SAXS) e/ou microscopia de fluorescência será desejável, mas não necessária. O candidato aprovado deve ter obtido o título de doutor há, no máximo, sete anos e possuir currículo comprovado com trabalhos publicados que demonstre capacitação para atuar no desenvolvimento do projeto. Candidatos devem possuir fluência em inglês e dedicar-se integralmente e exclusivamente às atividades do projeto. 

    Candidatos interessados devem enviar, até 02 de junho de 2019 os seguintes documentos para o e-mail chsfarah@iq.usp.br

    a) Uma carta de interesse;
    b) Curriculum vitae incluindo uma lista de publicações;
    c) Informações de contato (e-mail, telefone) de dois profissionais que podem fornecer cartas de recomendação. 

    The Department of Biochemistry at the University of São Paulo invites candidates to apply for a post-doctoral position in Molecular Microbiology and Structural Biology associated with the laboratory of Shaker Chuck Farah. 

    Granted by the São Paulo Research Foundation (FAPESP), the post-doctoral fellowship has an initial duration of 2 years with the possibility of extension for another two years, with a monthly stipend in the amount of R$ 7,373.10 (approximately US$ 2,000.00 per month). The fellowship also includes a research contingency fund, equivalent to 15% of the annual value of the fellowship which should be spent in items directly related to the research activity.

    The focus of this post-doctoral project is to understand structure-function relationships in the Xanthomonas citri type IV (T4P) pilus, a filamentous structure involved in bacterial motility and biofilm formation. Specifically, we plan to i) study the in vivo and in vitro interactions involving PilB, PilM and PilC associated with the bacterial inner membrane and the regulatory proteins PilZ and FimX; ii) study the structures of complexes involving PilB, PilM, PilC, PilZ and FimX employing crystallography, NMR and / or cryo-electron microscopy techniques; iii) isolate X. citri type IV pili (PilA polymers) and study their interactions with the φXacm4-11 bacteriophage that infects X. citri; and iv) determine the structure of bacteriophage φXacm4-11 (on its own and in complex with T4P) using cryo-electron microscopy. 

    The position is open to young scientists with a doctoral degree in Biochemistry, Chemistry, Biology, Physics, Biomedicine, Farmacology or related areas. The successful candidate should have previous experience in molecular biology, expression and purification of recombinant proteins and an interest in understanding molecular structure/function relationships in biological systems. Previous experience in structural biology techniques and / or microscopy would be an asset but is not required. Candidates should be proficient in the English language. 

    Interested candidates should send the following information by June 2, 2019 to chsfarah@iq.usp.br

    a) A letter describing previous research experience and professional interests;
    b) Curriculum vitae including a list of scientific publications;
    c) Contact information (e-mail, telephone) of two professionals that could provide letters of recommendation.