Bolsa de PD em Genômica e Bioinformática

Post-doctoral fellowship in Genomics and Bioinformatics

Nº: 1726

Área de conhecimento: Biologia Geral

Field of knowledge: General biology

Nº do processo FAPESP: 2016/50127-5

FAPESP process: 2016/50127-5

Título do projeto: Escalas da biodiversidade - estudos integrados da evolução e função do veneno de serpentes

Project title: scales of biodiversity: integrated studies of snake venom evolution and function across multiple levels of diversity

Área de atuação: Genômica e Bioinformática

Working area: Genomics and Bioinformatics

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Pesquisador principal: Inácio Junqueira de Azevedo

Principal investigator: Inácio Junqueira de Azevedo

Unidade/Instituição: Laboratório Especial de Toxinologia Aplicada/ Instituto Butantan

Unit/Instituition: Laboratório Especial de Toxinologia Aplicada/ Instituto Butantan

Data limite para inscrições: 22/09/2017

Deadline for submissions: 2017-09-22

Publicado em: 30/08/2017

Publishing date: 2017-08-30

Localização: Av. Vital Brasil, 1500, São Paulo

Locale: Av. Vital Brasil, 1500, São Paulo

E-mail para inscrições: scales.biodiversity@butantan.gov.br

E-mail for proposal submission: scales.biodiversity@butantan.gov.br

  • Resumo Summary

    A pesquisa referente ao projeto envolve geração e análise de dados transcriptômicos de glândulas orais de serpentes brasileiras, atuação no dry-lab na identificação e comparação dos níveis de expressão dos genes de toxinas e sua correlação com a diversificação dos grupos filogenéticas estudados. O selecionado também auxiliará na wet-lab do projeto (extração de RNA, preparo de bibliotecas, sequenciamento em sistema Illumina).

    Pré-requisitos

    1) Título de doutor em área correlata ao projeto;

    2) Comprovada experiência em projetos envolvendo análise transcriptômica por métodos de nova geração (RNAseq);

    3) Domínio do uso de ferramentas bioinformáticas para análise de dados transcriptômicos, incluindo montadores De Novo e ferramentas de quantificação da expressão gênica;

    4) Altamente desejável capacidade de desenvolver ferramentas e scripts bioinformáticos em sistema Linux;

    5) Desejável conhecimentos acerca de venenos e toxinas animais e/ou evolução de famílias gênicas;

    6) Desejável fluência em inglês.

    Interessados devem enviar e-mail para biodiversity.scales@butantan.gov.br até 22/09/2017, contendo:

    • CV (preferencialmente no formato Lattes);

    • Carta de apresentação justificando o interesse na vaga;

    • Contatos (nome, Instituição, telefone e e-mail) de dois a três pesquisadores que possam dar informações sobre o candidato. 

    The postdoctoral fellow should act in the generation and mainly in the analysis of transcriptomic data from oral glands of snakes. It is expected that he/she will aid in the wet-lab part of the project (RNA extraction, library preparation, sequencing in Illumina system), but will focus majorly on dry-lab activities, aiming the identification and comparison of expression levels of toxin genes and their correlation with the diversification of the phylogenetic groups studied.

    Qualifications for position

    1) Doctoral degree in area related to the project;

    2) Have proven experience in projects involving transcriptomic analysis by Next Generation methods (RNAseq) (prerequisite);

    3) Mastering the use of bioinformatic tools for the analysis of transcriptomic data, including de novo assemblers and tools for the quantification of gene expression (prerequisite);

    4) Have the ability to develop bioinformatic tools and scripts in a Linux system (highly desirable);

    5) Have knowledge about venoms and animal toxins and/or on evolution of gene families (desirable);

    6) Fluency in English is desirable.

    Candidates must reach Butantan Institute at biodiversity.scales@butantan.gov.br until September 22, forwarding:

    • CV (preferrably Lattes format);

    • Letter of introduction justifying your interest at the vacancy;

    • Contacts (name, institution, phone and e-mail) from two to three researchers that may give information on the candidate.