Bolsa de PD em Biofísica

Post-doctoral Fellowship in Biophysics

Nº: 3289

Área de conhecimento: Física

Field of knowledge: Physics

Nº do processo FAPESP: 2018/15316-7

FAPESP process: 2018/15316-7

Título do projeto: Desenvolvimento de modelo biofísico para aberrações cromossômicas induzidas por radiação ionizante.

Project title: Development of a biophysical model for chromosome aberrations induced by ionizing radiations

Área de atuação: Biofísica

Working area: Biophysics

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Início: 01/02/2020

Start: 2020-02-01

Pesquisador principal: Mario A. Bernal

Principal investigator: Mario A. Bernal

Unidade/Instituição: Instituto de Física

Unit/Instituition: Instituto de Física

Data limite para inscrições: 25/11/2019

Deadline for submissions: 2019-11-25

Publicado em: 31/10/2019

Publishing date: 2019-10-31

Localização: Rua Sérgio Buarque de Holanda, 777, Cidade Universitária, Campinas

Locale: Rua Sérgio Buarque de Holanda, 777, Cidade Universitária, Campinas

E-mail para inscrições: mbernalrod@gmail.com

E-mail for proposal submission: mbernalrod@gmail.com

  • Resumo Summary

    O Grupo de Física Radiológica Médica do IFGW-Unicamp pesquisa na área de Radiobiologia Computacional, com quase 20 anos de experiência. Para isso, nosso grupo desenvolve modelos biofísicos baseados na combinação de simulações Monte Carlo (MC) do transporte de radiação e modelos geométricos do material genético humano. Desde 2009, o grupo faz parte do projeto internacional Geant4-DNA, que visa estender o código MC Geant4 para energias muito baixas, de forma tal que possa ser usado no campo da micro e nanodosimetria.

    Neste específico projeto, pretendemos desenvolver um modelo 3D do material genético humano, desde o par de nucleotídeos até os cromossomos, com resolução atômica. A estrutura 3D dos cromossomos será reconstruída a partir de mapas Hi-C. Com esse modelo seríamos capazes de emular a indução de aberrações cromossômicas produzidas por virtualmente qualquer radiação ionizante, desde fótons até íons pesados.

    Estamos procurando candidato com sólida formação em Física, principalmente na área da interação de radiação com a matéria, Física Radiológica e simulações por Monte Carlo do transporte de radiação. O candidato deve também possuir ampla experiência em programação C++, Fortran e Python. Seria também muito desejável que o candidato tenha trabalhado com manipulação de mapas Hi-C e sua conversão a estruturas tridimensionais dos cromossomos.

    A vaga está aberta a brasileiros e estrangeiros. O selecionado receberá Bolsa de Pós-Doutorado da FAPESP no valor de R$ 7.373,10 mensais e Reserva Técnica equivalente a 15% do valor anual da bolsa para atender a despesas imprevistas e diretamente relacionadas à atividade de pesquisa.

    One post-doctoral fellowship is available at the Medical Radiological Physics Group (GFRMd) hosted by the Gleb Watahin Physics Institute of the University of Campinas (IFGW-UNICAMP), São Paulo State, Brazil. The group works in the field of the Computational Radiobiology, with experience of more than 18 years, developing biophysical models based on the combination of Monte Carlo (MC) simulation of the radiation transport and geometrical models of the human genetic material. Since 2009, GFRMd is part of the Geant4-DNA Collaboration, which aims at extending the Geant4 MC code down to very low energies, so that it can be used in the field of micro and nanodosimetry.

    The fellow will work at a project which specifically aims to develop a 3D model of the human genetic material, from the nucleotide pair up to the chromosome, with atomic resolution. The chromosome 3D structures will be reconstructed from Hi-C maps. With this model, it would be able to emulate the induction of chromosome aberrations produced by virtually any ionizing radiation, from photons to heavy ions.

    The vacancy requires a candidate with solid background in Physics, mainly in radiation-matter interaction, Radiological Physics, and MC simulation of radiation transport. The candidate must also have high skills on C++, Fortran, and Python programming. It would be desirable that the candidate has worked with the manipulation of Hi-C maps for their conversion into 3D chromosome structures.

    This opportunity is open to candidates of any nationalities. The selected candidate will receive a FAPESP’s Post-Doctoral fellowship in the amount of R$ 7,373.10 monthly and a research contingency fund, equivalent to 15% of the annual value of the fellowship which should be spent in items directly related to the research activity.