Bolsa de PD em Biologia de Anfíbios

Post-doctoral Fellowship in Amphibian Biology

Nº: 2604

Área de conhecimento: Zoologia

Field of knowledge: Zoology

Nº do processo FAPESP: 2018/07586-4

FAPESP process: 2018/07586-4

Título do projeto: Cores escondidas na floresta: genética evolutiva dos padrões de cores de anuros neotropicais

Project title: Colours hidden in the forest: evolutionary genomics of colour patterns in Neotropical frogs

Área de atuação: Biologia de anfíbios

Working area: Amphibian biology

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Pesquisador principal: Célio F. B. Haddad

Principal investigator: Célio F. B. Haddad

Unidade/Instituição: Instituto de Biociências, UNESP, Rio Claro

Unit/Instituition: Instituto de Biociências, UNESP, Rio Claro

Data limite para inscrições: 25/02/2019

Deadline for submissions: 2019-02-25

Publicado em: 28/01/2019

Publishing date: 2019-01-28

Localização: Avenida 24A, 1515, Bela Vista, Rio Claro

Locale: Avenida 24A, 1515, Bela Vista, Rio Claro

E-mail para inscrições: haddad1000@gmail.com

E-mail for proposal submission: haddad1000@gmail.com

  • Resumo Summary

    O Laboratório de Herpetologia da Universidade Estadual Paulista “Júlio de Mesquita Filho” (UNESP), campus de Rio Claro, busca um (a) candidato (a) altamente motivado (a) para oportunidade de bolsa de Pós-Doutorado vinculada ao projeto “Cores escondidas na floresta: genética evolutiva dos padrões de cores de anuros neotropicais”, financiado pela FAPESP. O (a) candidato (a) deverá morar na cidade da instituição sede: Rio Claro, SP. Além disso, algumas partes do projeto serão realizadas na Universidade do Porto, Portugal, e o candidato deverá ter disponibilidade para passar algumas temporadas nesse país. A duração inicial da bolsa é de 24 meses.

    O (a) candidato (a) deverá ter obtido seu doutorado há menos de 2 anos em Zoologia e ter publicado pelo menos um artigo oriundo do seu doutorado em periódicos internacionais e de alto impacto. Devido à natureza interdisciplinar do projeto, é necessário que o (a) candidato (a) tenha experiência (comprovada por meio de publicações) com sequenciamento de alto rendimento, análises morfológicas e bioacústicas de anuros neotropicais, sendo altamente desejável experiência com a família Hylidae.

    Um dos objetivos do projeto é a formação de pessoal e é primordial que o candidato tenha experiência prévia com orientação de alunos. Também é desejável que o (a) candidato (a) possua algum tipo de curso em sequenciamento de alto rendimento e/ou bioinformática.

    O (a) candidato (a) deve ter excelente comunicação verbal e escrita em inglês e é necessário também que o (a) candidato (a) possa se comunicar em português e tenha experiência com trabalhos de campo na região Neotropical.

    O projeto é uma parceria Brasil/Portugal e é fundamental que o (a) candidato (a) tenha tido experiência internacional anterior, tal como doutorado sanduíche, BEPE (FAPESP) ou algum estágio realizado em país diferente do país em que o (a) candidato (a) realizou seu doutorado.

    A vaga está aberta a brasileiros e estrangeiros. O selecionado receberá bolsa de Pós-Doutorado da FAPESP no valor de R$ 7.373,10 mensais e Reserva Técnica equivalente a 15% do valor anual da bolsa para atender a despesas imprevistas e diretamente relacionadas às atividades de pesquisa.

    Interessados ou interessadas devem mandar o curriculum vitae para Célio Haddad (haddad1000@gmail.com) com o assunto em maiúsculo: “APLICAÇÃO PARA VAGA DE PÓS-DOUTORADO” até às 23h59 do dia 25 de fevereiro de 2019 (horário de Brasília). O resultado será divulgado em até duas semanas após o prazo final das inscrições, no e-mail dos candidatos.

    Projeto de pesquisa

    O estudo dos processos evolutivos que originam diversidade fenotípica é fundamental para entender o processo de adaptação em populações naturais. Os padrões de coloração são características notáveis para entender os mecanismos mutacionais subjacentes à diversidade fenotípica e o modo como estes afetam os padrões de mudança evolutiva.

    Entre os vertebrados, os anfíbios são um dos grupos mais interessantes, exibindo uma vasta variação de padrões de coloração, cuja função está associada à termorregulação, proteção UV, comunicação e defesa. Apesar dos avanços significativos neste tópico, quer em vertebrados como em invertebrados, as bases genéticas da coloração em anfíbios permanecem surpreendentemente desconhecidas.

    As rãs-folha sul americanas do grupo Phyllomedusa burmeisteri, que vêm sendo estudadas pela nossa equipe, é um bom modelo para o estudo da evolução da variação dos padrões de coloração em anfíbios. Em primeiro lugar, essas espécies apresentam variação no padrão de cores brilhantes que exibem nas faces ocultas das coxas, que é interpretada como um caso de aposematismo, uma das estratégias de defesa mais difundidas entre os anfíbios neotropicais. Em segundo lugar, diferentes padrões de coloração coexistem em populações naturais, oferecendo, assim, uma oportunidade única para estudos de mapeamento genético.

    Finalmente, essas espécies possuem uma zona de contato bem definida, tornando esse sistema um excelente modelo para entender o impacto da variação dos padrões de coloração na dinâmica da especiação e do modo como a seleção modela a variação fenotípica e genética. Este projeto visa investigar as bases genéticas e processos evolutivos da variação dos padrões de coloração em anfíbios. Para isso, pretendemos: 1) realizar análises de associação fenótipo/genótipo utilizando técnicas de sequenciamento de DNA de alto rendimento, incluindo captura de exoma e sequenciamento de RNA; 2) estudar a expressão gênica de loci candidatos em diferentes estágios de desenvolvimento; e 3) contrastar os padrões de mudança de frequência alélica ao longo da zona de contato entre loci candidatos e outros loci aleatoriamente distribuídos no genoma.

    Além dos objetivos específicos, pretendemos que os dados genômicos deste projeto constituam a base para futuros estudos evolutivos e de conservação e, especialmente, para a investigação em medicina humana, uma vez que estes anfíbios são uma fonte de peptídeos com aplicações nanobiotecnológicas. Esta proposta será conduzida por uma equipe internacional (Brasil e Portugal), que desenvolve pesquisa conjunta há 10 anos na evolução dos anfíbios neotropicais.

    Combinando pesquisadores com larga experiência em estudos eco-evolutivos com especialistas na geração e análise de dados genômicos, esta proposta constitui uma rara oportunidade para entender os mecanismos que moldam a variação fenotípica e o modo como esses afetam os padrões de mudança evolutiva. Esta proposta também oferecerá a oportunidade de treinamento avançado a estudantes de mestrado e doutorado, bem como o aprimoramento de pós-doutores. 

    The Herpetology Lab of the São Paulo State University (UNESP), campus of Rio Claro, São Paulo, Brazil, seeks a highly motivated candidate for a postdoctoral fellowship linked to the project "Colours hidden in the forest: evolutionary genomics of colour patterns in Neotropical frogs", funded by FAPESP. The successful candidate will live in Rio Claro, state of São Paulo, Brazil.

    Moreover, part of the project will be held at the University of Porto, Portugal, and the candidate should be willing to spend some seasons in Portugal. The initial duration of the postdoctoral position is 24 months.

    The candidate must have obtained his doctorate within the last two years in Zoology and must have published at least one article from his doctorate in international and high impact journals. In addition, due to the interdisciplinary nature of the project, it is necessary for the candidate to have experience (proven through scientific publications) with high-throughput sequencing and morphological and bioacoustics analyzes of Neotropical anurans.

    Experience with family Hylidae sensu lato is highly desirable. One of the objectives of the project is the training of personnel, and it is essential that the candidate has prior experience with student mentoring. It is also desirable that the candidate has attended some kind of course or workshop in high-throughput sequencing and / or bioinformatics.

    The candidate must have excellent verbal and written communication in English, and it is also necessary that the candidate can communicate in Portuguese and have experience with fieldwork in the Neotropical region.

    The project is a partnership between Brazil and Portugal, and it is essential that the candidate has had previous international experience curricularly demonstrated.

    The vacancy is open to Brazilians and foreigners. The selected candidate will receive FAPESP Post-Doctoral Fellowship in the amount of BRL 7,373.10 per month and Technical Reserve equivalent to 15% of the annual value of the scholarship to meet unforeseen expenses directly related to the research activities.

    Interested candidates should send the curriculum vitae to Professor Célio Haddad (haddad1000@gmail.com) with the subject, in the upper box: "APPLICATION FOR POST-DOCTORATE POSITION" until 23:59 (GMT -2:00) on February 25, 2019. The result will be announced within two weeks after the deadline for submissions, by e-mail.

    The Project

    The study of the evolutionary processes that originate phenotypic diversity is one of the most important endeavours in biology because it can offer insights into the process of adaptation in natural populations. Colouration patterns are remarkable traits for studying the mutational mechanisms underlying phenotypic diversity and how these affect patterns of evolutionary change.

    Among vertebrates, amphibians are one of the most interesting groups, exhibiting a vast variation in colouration, whose function has been mainly associated with thermoregulation, UV protection, conspecific communication, and predator avoidance. Despite significant advances have been made on this topic in both invertebrates and vertebrates, the genetic basis of colouration in amphibians is still surprisingly unknown.

    The South American leaf-frogs of the Phyllomedusa burmeisteri group, which have been widely studied by our research team, is a compelling case to study the evolution of colour pattern diversity in amphibians. First, they present striking variation in the patterns of bright colours at the hidden surfaces of thighs, which have been interpreted as a case of aposematism, one of the most widespread defensive strategy among Neotropical amphibians. Second, colour morphs variants coexist in some populations, offering, thus a unique opportunity for genetic mapping studies.

    Finally, these species meet in a well-defined contact zone, making this system an excellent model to understand the impact of colour polymorphism in the dynamics of speciation, and how selection shapes both phenotypic and genetic variation.

    The proposed research seeks to investigate the genetic bases and evolutionary processes underlying colour variation in amphibians. To this end, we will 1) perform a genome-wide association analysis using high-throughput DNA sequencing techniques, including exome capture and RNA sequencing; 2) study gene expression of associated genes in several developmental stages; and 3) investigate patterns of allele frequency change across the contact zone for causative loci and randomly chosen markers.

    Beyond these specific goals, we are convinced that the genomic data generated for the target species will be an important resource for further evolutionary studies, conservation efforts, and in particular for human medicinal research, since phyllomedusids are a rich source of peptides with great nanobiotechnological applications. With an International team of researchers with complementary skills and expertise, with 10-years' experience in developing joint research, we expect to be at the forefront of this underexplored evolutionary field, publishing articles in leading international journals and produce outreach publications for enhancing awareness and/or disseminating research based information to the general public.

    This proposal will offer the opportunity for advance training to MSc and PhD students, and provide one postdoctoral contract.