Bolsa de PD em Bioquímica

Post-doctoral in Biochemistry

Nº: 2199

Área de conhecimento: Bioquímica

Field of knowledge: Biochemistry

Nº do processo FAPESP: 2015/50040-4

FAPESP process: 2015/50040-4

Título do projeto: Centro de Excelência para Descoberta de Novos Alvos (CENTD)

Project title: Centre of Excellence in New Target Discovery (CENTD)

Área de atuação: Bioquímica ou Química

Working area: Chemistry or Biochemistry

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Início: 03/09/2018

Start: 2018-09-03

Pesquisador principal: Ana Marisa Chudzinski Tavassi

Principal investigator: Ana Marisa Chudzinski Tavassi

Unidade/Instituição: Laboratório de Biologia Molecular/Instituto Butantan

Unit/Instituition: Laboratório de Biologia Molecular/Instituto Butantan

Data limite para inscrições: 30/07/2018

Deadline for submissions: 2018-07-30

Publicado em: 27/06/2018

Publishing date: 2018-06-27

Localização: Avenida Vital Brasil, 1500, São Paulo

Locale: Avenida Vital Brasil, 1500, São Paulo

E-mail para inscrições: centd@butantan.gov.br

E-mail for proposal submission: centd@butantan.gov.br

  • Resumo Summary

    O Centro de Excelência para Descoberta de Novos Alvos (CENTD), uma nova parceria entre a FAPESP, Glaxo-Smith Kline (GSK) e o Instituto Butantan, tem uma posição de pós-doutorado disponível no Laboratório CENTD do Instituto Butantan, em São Paulo, Brasil.

    O bolsista terá a oportunidade de trabalhar na identificação de alvos moleculares e de vias de sinalização relacionados a processos inflamatórios em osteoartrite, artrite reumatoide, remodelagem tecidual e câncer, doenças metabólicas e neurodegenerativas, utilizando como ferramentas toxinas de animais venenosos.
    Como requisitos, o candidato deve ter doutorado em Química, Bioquímica ou áreas correlatas, ter pelo menos dois artigos como primeiro autor em revistas internacionais, motivação para resolver problemas biológicos complexos no campo da descoberta de alvos moleculares.

    Também deve ter experiência comprovada na preparação de amostras (extração de proteínas, digestão em solução e in-gel, derivatização química, metabólica, dessalinização, descomplexação de amostras de proteínas e peptídeos por cromatografia de troca iônica e fase reversa) para as análises proteômicas a partir de abordagens do tipo shotgun bottom-up, incluindo as técnicas de DDA, DIA, PRM e SRM para caracterização e quantificação de proteínas alvo. O candidato deverá ter experiência conceitual e prática em sistemas de nano-cromatografia líquida acoplada à espectrometria de massas de alta resolução e análise dos dados gerados pela plataforma de LC-MS/MS, preferencialmente no uso dos instrumentos EASY-nLC1200 (Thermo Scientific) acoplado ao espectrômetro de massas Q Exactive Plus (Thermo Scientific). Preferencialmente serão selecionados os candidatos que dominem as principais ferramentas de busca em banco de dados para as análises direcionadas ao estudo de proteomas (MaxQuant, Skyline, Mascot, TPP, Sequest, etc.). Experiência em bioinformática também é desejada.

    Inglês fluente (comunicação e escrita), além da capacidade de trabalhar em um time interdisciplinar são requisitos essenciais.

    Os candidatos interessados devem apresentar seus pedidos incluindo: carta de apresentação descrevendo realizações de pesquisa, curriculum vitae e duas cartas de recomendação. Por favor, enviar os documentos para Dra. Ana Marisa Chudzinski Tavassi (centd@butantan.gov.br; ana.tavassi@butantan.gov.br).

    Essa oportunidade está aberta a candidatos de todas as nacionalidades. O candidato selecionado receberá bolsa de Pós-Doutorado da FAPESP, no valor de R$ 7.174,80 mensais e um fundo de contingência de pesquisa, equivalente a 15% do valor anual da bolsa e que deve ser gasto em itens diretamente relacionados às atividades de pesquisa.

    Aqueles que precisarem se deslocar para a cidade onde está localizada a sede da instituição de pesquisa podem solicitar o benefício de assistência financeira de instalação, compreendendo:
    - Uma taxa mensal adicional a ser paga juntamente com o primeiro mês da bolsa;
    - Custos de transporte, se houver deslocamento por distância superior a 350km (visite http://www.fapesp.br/270).

    Prazo para candidaturas: 30 de julho de 2018.

    Data de início: 03 de setembro de 2018.

    Duração: Inicialmente 2 anos, com opção de prorrogação.

     

    The Centre of Excellence in New Target Discovery (CENTD), a new partnership among São Paulo Research Foundation-FAPESP, Glaxo-Smith Kline (GSK) and Butantan Institute, has a postdoctoral position available in the Laboratory of Molecular Biology at Butantan Institute, São Paulo, Brazil.

    The postdoctoral fellow will have the opportunity to work in projects on the identification/elucidation and validation of new targets/pathways related to inflammatory processes in osteoarthritis, rheumatoid arthritis, tissue remodeling/cancer, metabolic and neurodegenerative diseases, using as tools toxins from poisonous animals.

    As requirements, candidates must hold a PhD in Chemistry, Biochemistry or related fields, having at least two articles as first author in international journals, motivation to solve biological complex problems in the field of molecular targets.

    Proven experience in sample preparation (protein extraction, solution and in-gel digestion, chemical derivatization, metabolic, desalination, decomplexing of protein and peptide samples by ion exchange chromatography and reversed phase) for proteomic analysis from approaches like shotgun bottom-up, including techniques of DDA, DIA, PRM and SRM for characterization and quantification of target proteins. The candidate should have conceptual and practical experience in liquid nano-chromatography coupled to high resolution mass spectrometry and analysis of the data generated by the LC-MS/MS platform, preferably using the coupled EASY-nLC1200 (Thermo Scientific) instruments coupled to mass spectrometer Q Exactive Plus (Thermo Scientific). Preferably, candidates will be selected who dominate the proteomic database search tools (MaxQuant, Skyline, Mascot, TPP, Sequest, etc.). Experience in bioinformatics is also desired.

    Fluent English (conversation and writing) and ability to work in an interdisciplinary team are essential requirements.

    Interested applicants should submit an application including a cover letter outlining research accomplishments, resumé, two recommendation letters. Please send the application to Ana Marisa Chudzinski Tavassi, PhD (centd@butantan.gov.br).

    This opportunity is open to candidates of any nationalities. The selected candidate will receive a FAPESP's Post-Doctoral fellowship in the amount of R$ 7.174,80 (around $ 2,115.00 USD) monthly and a research contingency fund, equivalent to 15% of the annual value of the fellowship which should be spent in items directly related to the research activity.

    Installation financial assistance:

    Those who need to move to the city, where the headquarters of the research institution is located, may request the benefit Installation financial assistance, comprising:

    One (1) additional monthly fee to be paid along with the first month of the fellowship;

    Transportation costs, if any displacement by distance exceeding 350 km - see: http://www.fapesp.br/en/5427.

    Deadline for applications: Jul, 30, 2018

    Starting date: Sep, 03, 2018

    Duration: Initially 2 years with option of further extension.