Bolsa de PD em Mutagênese e Carcinogênese

Post-doctoral Fellowship in Mutagenesis and Carcinogenesis

Nº: 1930

Área de conhecimento: Biologia Geral

Field of knowledge: General biology

Nº do processo FAPESP: 2014/15982-6

FAPESP process: 2014/15982-6

Título do projeto: Caracterização genotípica de pacientes xeroderma pigmentosum (XP) brasileiros e procura por efeitos fundadores

Project title: Genotypic characterization of Brazilian xeroderma pigmentosum (XP) patients and investigation on the historical search for founding effects

Área de atuação: Biologia Molecular, Mutagênese, Carcinogênese, Genética

Working area: Molecular Biology, Mutagenesis, Carcinogenesis, Genetics

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Pesquisador principal: Carlos Frederico Martins Menck

Principal investigator: Carlos Frederico Martins Menck

Unidade/Instituição: Instituto de Ciências Biomédicas, USP

Unit/Instituition: Instituto de Ciências Biomédicas, USP

Data limite para inscrições: 15/03/2018

Deadline for submissions: 2018-03-15

Publicado em: 09/02/2018

Publishing date: 2018-02-09

Localização: Av. Prof. Lineu Prestes, 1374, São Paulo, SP

Locale: Av. Prof. Lineu Prestes, 1374, São Paulo, SP

E-mail para inscrições: DNArepaircoregenome@gmail.com

E-mail for proposal submission: DNArepaircoregenome@gmail.com

  • Resumo Summary

    O Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo, dispõe de uma vaga de pós-doutorado, com bolsa da FAPESP, junto ao projeto Temático “Consequências de deficiência de reparo de lesões no genoma” (CORE_GENOME, processo 2014/15982-6). Este projeto será desenvolvido sob supervisão do Dr. Carlos Frederico Martins Menck e as inscrições serão recebidas até 15 de março de 2018. 

    O projeto a ser envolvido refere-se à caracterização genotípica de pacientes xeroderma pigmentosum (XP) brasileiros e procura por efeitos fundadores em mutações já identificadas. O projeto busca a identificação de variantes patogênicas para diagnóstico molecular de mutações na síndrome genética XP de pacientes brasileiros. Além disso, busca a investigação da origem e ancestralidade de mutações já reportadas na literatura através da análise dos haplótipos desses pacientes. 

    Os candidatos deverão ter experiência com as plataformas de sequenciamento de nova geração (NGS), capazes de preparar bibliotecas para sequenciamento e análise dos dados para identificação das variantes. Conhecimentos básicos de biologia molecular como PCR, SNP-array, sequenciamento Sanger e familiaridade com pipelines para análise de bioinformática serão requeridos. Além disso, os candidatos deverão ter experiência em cultura celular e formas de analisar respostas a lesões no genoma. Quanto à formação, exige-se para a vaga candidatos com doutorado ou PhD em Genética, Biologia Molecular, Bioquímica ou área correlata. 

    Os candidatos devem enviar para o professor Menck, pelo email DNArepaircoregenome@gmail.com, os seguintes documentos: curriculum vitae, uma carta de apresentação explicando as razões do interesse no projeto, duas cartas de recomendação de docentes da área com os quais já trabalharam e um plano de trabalho de 10 páginas descrevendo que abordagens o candidato propõe para responder às perguntas científicas pertinentes a este projeto.

    A oportunidade está aberta a brasileiros e estrangeiros. O selecionado receberá Bolsa de Pós-Doutorado da FAPESP no valor de R$ 7.174,80 mensais e Reserva Técnica, que equivale a 15% do valor anual da bolsa e tem o objetivo de atender a despesas imprevistas e diretamente relacionadas à atividade de pesquisa. Mais informações sobre a Bolsa de Pós-Doutorado da FAPESP estão disponíveis em www.fapesp.br/bolsas/pd.

    The Institute of Biomedical Sciences, University of São Paulo, offers a post-doctoral position, with a Sao Paulo Research Foundation - FAPESP scholarship, linked to the Project “Consequences of repair deficiencies in damaged genome" (CORE GENOME, Process # 2014/15982-6). This project will be developed under the supervision of Dr. Carlos Frederico Martins Menck and applications should be submitted before March 15th 2018.

    The project to be developed involves the genotypic characterization of Brazilian xeroderma pigmentosum  (XP) patients and investigation on the historical search for founding effects on known mutations. The project aims to provide molecular diagnosis for a rare human genetic disease such as XP at Brazilian patients and investigate the origins and ancestries of some of these mutations, already reported in the literature by the analysis of their haplotypes.

    Candidates should have prior experience with next-generation sequencing platforms (NGS) capable of preparing libraries for sequencing and data analysis for variant identification. Basic knowledge of molecular biology such as PCR, SNP-array, sanger sequencing and familiarity with bioinformatics analysis will be required. Moreover, candidates must have experience in cell culture techniques and methodology to investigate DNA damage in cells’ genome. Concerning academic education, applicants are required to have PhD in Genetics, Molecular Biology, Biochemistry or related area.

    Candidates must submit to professor Menck (DNArepaircoregenome@gmail.com) a letter detailing their motivation and interest in this work, an updated CV including past research experience and publication records, two recommendation letters, and a 10-page work plan outlining what approaches will be proposed to answer the scientific questions pertaining to this project.

    The opportunity is open to Brazilians and foreigners. The fellow will receive FAPESP Post-Doctoral Fellowship in the amount of R$ 7,174.80 per month and Technical Reserve. The Technical Reserve of PD Grant is equivalent to 15% of the annual value of the scholarship. More information about the FAPESP Postdoctoral Fellowship is available at www.fapesp.br/en/5427.