Bolsa de PD em Epidemiologia Molecular da Malária

Post-doctoral Fellowship in Molecular Epidemiology of Malaria

Nº: 1750

Área de conhecimento: Parasitologia

Field of knowledge: Parasitology

Nº do processo FAPESP: 2016/18740-9

FAPESP process: 2016/18740-9

Título do projeto: Bases científicas para a eliminação da malária residual na Amazônia brasileira

Project title: Scientific bases for residual malaria elimination in the Brazilian Amazon

Área de atuação: Epidemiologia Molecular da Malária

Working area: Molecular Epidemiology of Malaria

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Início: 01/04/2018

Start: 2018-04-01

Pesquisador principal: Marcelo Urbano Ferreira

Principal investigator: Marcelo Urbano Ferreira

Unidade/Instituição: Instituto de Ciências Biomédicas da USP

Unit/Instituition: Instituto de Ciências Biomédicas da USP

Data limite para inscrições: 22/12/2017

Deadline for submissions: 2017-12-22

Publicado em: 19/09/2017

Publishing date: 2017-09-19

Localização: Av. Prof. Lineu Prestes 1374, São Paulo

Locale: Av. Prof. Lineu Prestes 1374, São Paulo

E-mail para inscrições: muferrei@gmail.com

E-mail for proposal submission: muferrei@gmail.com

  • Resumo Summary

    A vaga está vinculada ao Projeto Temático “Bases científicas para a eliminação da malária residual na Amazônia brasileira”, coordenado pelo Prof. Marcelo Urbano Ferreira.

    Este projeto tem suas atividades de campo realizadas no Vale do Juruá, estado do Acre, que concentra 20% dos casos de malária registrados no Brasil. Visa a testar a hipótese de que os portadores assintomáticos de infecção contribuem decisivamente para a manutenção da malária residual, constituindo-se em um alvo essencial para as estratégias de controle.

    O bolsista, sediado em São Paulo (com estágio sanduíche previsto na Escola de Saúde Pública de Harvard, sob a orientação da Profa. Marcia Caldas de Castro), receberá amplo treinamento em gerenciamento e análise de dados epidemiológicos e em análise espacial e será responsável tanto pela criação e gerenciamento de banco de dados como pela análise estatística e espacial desses dados, contribuindo decisivamente para a redação de relatórios e artigos.

    As pesquisas desenvolvidas no âmbito do projeto envolvem o uso de diversos métodos estatísticos para descrever padrões espaço-temporais de prevalência e incidência de malária na área de estudo, bem como de dados de genotipagem molecular e sequenciamento genômico de parasitos. 

    Pré-requisitos para a vaga:

    - Título de doutor em área correlata ao projeto (por exemplo, Epidemiologia, Saúde Pública, Parasitologia, Estatística);
    - Experiência em projetos envolvendo análise epidemiológica;
    - Domínio de programas de análise estatística como Stata e R;
    - Conhecimentos básicos de programação;
    - Domínio da língua inglesa (escrita e falada) e do português ou espanhol;
    - Disponibilidade para viagens (realização de trabalho de campo no estado do Acre);
    - Experiência com métodos moleculares de genotipagem e sequenciamento genômico são desejáveis. 

    Os interessados devem enviar até 22 de dezembro e-mail para muferrei@usp.br, contendo curriculum vitae (CV Lattes ou equivalente), carta de apresentação justificando o interesse na vaga e contatos (nome, instituição, telefone e e-mail) de dois a três pesquisadores que possam dar informações sobre o candidato. 

    A vaga está aberta a brasileiros e estrangeiros. O selecionado receberá Bolsa de Pós-Doutorado da FAPESP no valor de R$ 7.174,80 mensais e Reserva Técnica. A Reserva Técnica de Bolsa de PD equivale a 15% do valor anual da bolsa e tem o objetivo de atender a despesas imprevistas e diretamente relacionadas à atividade de pesquisa.

    Caso o bolsista de PD resida em domicílio diferente e precise se mudar para a cidade onde se localiza a instituição-sede da pesquisa, poderá ter direito a um Auxílio-Instalação. Mais informações sobre a Bolsa de Pós-Doutorado da FAPESP estão disponíveis em fapesp.br/bolsas/pd

    This postdoctoral fellow will be primarily involved in a 4-year prospective cohort study that will examine the transmission dynamics of malaria parasites in residual malaria hotspots in the Amazon Basin of Brazil. 

    With 143,910 laboratory-confirmed cases and 41 malaria-related deaths in 2014, Brazil has now the lowest malaria burden in 35 years, with transmission virtually limited to the Amazon Basin. Accordingly, the Ministry of Health of Brazil has launched, in November 2015, the Malaria Elimination Plan, with the short-term goal of interrupting Plasmodium falciparum transmission countrywide over the next 15 years. The focal nature of malaria transmission in Brazil suggests that elimination efforts will require a careful prioritization of a few residual malaria foci of transmission.

    The study will test the hypotheses that: (a) asymptomatic parasite carriage is a major contributor to malaria transmission in these settings, and (b) the changing dynamics of malaria in these settings is directly associated to serial replacements of genetically diverse parasite populations over time and space. 

    This investigation is part of São Paulo Research Foundation -- FAPESP's Thematic Project titled "Scientific bases for residual malaria elimination in the Brazilian Amazon", under coordination of Professor Marcelo Urbano Ferreira, from the University of São Paulo's Biomedical Sciences Institute (ICB/USP). 

    Our ongoing studies combine classical epidemiological approaches that characterize risk factors and intervention targets, with population genetics/genomics analyses of parasites, with the ultimate goal of improving current strategies for malaria control and elimination in Brazil.

    Activities under this postdoctoral fellowship will include management of databases, data analysis, graphical representation of results, preparation of manuscripts for publication, laboratory work (upon proper training), and field work support.

    Field work will take place in the state of Acre, north of Brazil, where 20% of all malaria cases registered in Brazil are found. The fellow will be based in São Paulo and should take part in a sandwich placement in the Harvard School of Public Health under the supervision of Professor Marcia Caldas de Castro.

    Qualifications

    1) Doctoral degree in area related to the project (Epidemiology, Public Health, Genetics, Parasitology/Microbiology etc.);

    2) Experience in epidemiological data analysis and use of common software such as Stata and R (prerequisite);

    3) Availability for further training in statistical and spatial analyses (at least 6 months) at the Harvard T.H. Chan School of Public Health (Boston, USA), under the supervision of Prof. Marcia C. Castro (prerequisite);

    4) Basic programming skills (writing scripts in R and other languages) (highly desirable);

    5) Previous experience with laboratory methods for genotyping and genome sequencing (desirable);

    6) Availability for travel to field sites in the Amazon (desirable);

    7) Fluency in English is mandatory; fluency in Portuguese or Spanish is highly desirable.

    How to apply

    Candidates must send an e-mail to muferrei@gmail.com until December 22, 2017, with the following:

    • Short CV (up to 5 pages; preferably Lattes or NIH-style biosketch);

    • Statement (up to 3 pages) explaining the interest in this position;

    • References (name, institution, phone number and e-mail) from two to three previous mentors who can provide information on the candidate.