Bolsa de Mestrado em Bioinformática

Master's Fellowship in Bioinformatics

Nº: 2475

Área de conhecimento: Genética

Field of knowledge: Genetics

Nº do processo FAPESP: 2017/23205-8

FAPESP process: 2017/23205-8

Título do projeto: Avaliação do Impacto de Vírus Emergentes e Re-emergentes em Hemoterapia e Transplante de Células-Tronco por Meio de Técnicas Moleculares Avançadas

Project title: Evaluation of the Impact of Emerging and Reemerging Viruses in the Field of Hemotherapy and Stem Cell Transplantation by Multiple-Research Approach

Área de atuação: Bioinformática, Taxonomia Viral, Metagenômica, Sequenciamento de Última Geração

Working area: Bioinformatics, Viral Taxonomy, Metagenomics, Next Generation Sequencing

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Pesquisador principal: Svetoslav Nanev Slavov

Principal investigator: Svetoslav Nanev Slavov

Unidade/Instituição: Hemocentro de Ribeirão Preto, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo

Unit/Instituition: Hemocentro de Ribeirão Preto, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo

Data limite para inscrições: 20/12/2018

Deadline for submissions: 2018-12-20

Publicado em: 31/10/2018

Publishing date: 2018-10-31

Localização: Rua Tenente Catão Roxo, 2501, Ribeirão Preto

Locale: Rua Tenente Catão Roxo, 2501, Ribeirão Preto

E-mail para inscrições: svetoslav.slavov@hemocentro.fmrp.usp.br

E-mail for proposal submission: svetoslav.slavov@hemocentro.fmrp.usp.br

  • Resumo Summary

    O Laboratório de Biologia Molecular do Hemocentro de Ribeirão Preto oferece 1 (uma) vaga para aluno de mestrado com noções básicas de bioinformática. O aluno será responsável pela otimização e implementação de pipeline para análise da metagenoma viral (filtragem de sequências, alinhamentos e designação taxonômica e montagem de genomas de novo) obtido a partir de plasma de diversos grupos de pacientes e hemocomponentes. Para começar o trabalho, o aluno receberá treinamento de pesquisadores internacionais (Instituto Pasteur, França) e será orientado pelo Dr. Svetoslav Slavov (http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4445592J2). Os valores da bolsa de mestrado e a reserva técnica são pré-estabelecidos pela FAPESP.

    O Hemocentro de Ribeirão Preto é líder nacional em pesquisas apoiados pela FAPESP, CNPq e FINEP e uma infraestrutura de excelência. Mais de 100 pesquisadores atuam no Hemocentro em diversos áreas de investigação. Uma das linhas principais de pesquisa envolve também as doenças infecciosas que são transmissíveis pela transfusão de sangue e as medidas de prevenção da transmissão transfusional das mesmas.

    Conhecimento básicos exigidos: Linux; Linguagens de programação perl, python e/ou R; Banco de dados; Análise de dados de sequenciamento de nova geração.

    Os interessados, por favor enviar currículo, carta de motivação e uma recomendação até dia 20/12/2018 para a secretaria do setor de pesquisa do Hemocentro de Ribeirão Preto (carmen@hemocentro.fmrp.usp.br) mencionando Mestrado_FAPESP_Slav e com cópia para o responsável (svetoslav.slavov@hemocentro.fmrp.usp.br). 

    The Laboratory of Molecular Biology from the Blood Center of Ribeirão Preto, Brazil, offers one position for a master degree student with a basic knowledge of bioinformatics. The student will be responsible for the optimization and the implementation of a pipeline for the analysis of the viral metagenome (filtering sequences, alignments, taxonomic designation, de novo genome assembly) obtained from plasma and hemoderivatives. To start the working of this project, the student will receive training by international researchers from the Pasteur Institute. The student will be supervised by Dr. Svetoslav Slavov (https://bv.fapesp.br/en/pesquisador/83362/svetoslav-nanev-slavov/). The scholarship and the technical reserve values are pre-establshed by the Sao Paulo Research Foundation -- FAPESP.

    The blood center of Ribeirão Preto is a leading research institution which is funded by FAPESP, Brazil's National Council for Scientific and Technological Development -- CNPq and the Brazilian Innovation Agency -- FINEP, and has an excellent infrastructure. More than 100 researchers work in the Blood Center of Ribeirão Preto in different research areas. One of the main lines of investigations includes the infectious diseases which can be transmitted via blood transfusion and the measures which can be undertaken to prevent such a process. 

    Basic requirements: Linux; Program languages perl, python, and/or R; data banks; Analysis of next generation sequencing raw data is a plus. 

    Those who are interested in this position, please send your CV, motivation letter and one recomendation letter of the Secretariat of Research of the Blood Center of Ribeirão Preto until 20/12/2018 (carmen@hemocentro.fmrp.usp.br) mentioning the running head Mestrado_FAPESP_Slav and with a copy to svetoslav.slavov@hemocentro.fmrp.usp.br