Bolsa de PD em Imunologia Sistêmica

Post-doctoral Fellowship in Systems Immunology

Nº: 3688

Área de conhecimento: Imunologia

Field of knowledge: Immunology

Nº do processo FAPESP: 2020/07069-0

FAPESP process: 2020/07069-0

Título do projeto: Análise sistêmica e integrativa dos mecanismos de exaustão dos linfócitos T de pacientes com COVID-19

Project title: Systemic and integrative analysis of T lymphocyte exhaustion mechanisms in patients with COVID-19

Área de atuação: Imunologia Sistêmica

Working area: Systems Immunology

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Início: 01/07/2020

Start: 2020-07-01

Pesquisador principal: Otavio Cabral Marques

Principal investigator: Otavio Cabral Marques

Unidade/Instituição: Departamento de Imunologia, Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo

Unit/Instituition: Departamento de Imunologia, Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo

Data limite para inscrições: 30/06/2020

Deadline for submissions: 2020-06-30

Publicado em: 10/06/2020

Publishing date: 2020-06-10

Localização: Av. Prof. Lineu Prestes, 1730 - Butantã, São Paulo

Locale: Av. Prof. Lineu Prestes, 1730 - Butantã, São Paulo

E-mail para inscrições: otavio.cmarques@gmail.com

E-mail for proposal submission: otavio.cmarques@gmail.com

  • Resumo Summary

    Uma posição de Pós Doutorado em tempo integral está disponível na área de Imunologia Sistêmica e Integrativa, no Departamento de Imunologia do Instituto de Ciências Biomédicas (ICB) da Universidade de São Paulo.

    Este projeto objetiva realizar uma análise sistêmica e integrativa de dados de RNAseq, oriundo de células do sistema imune, depositados em banco de dados tais como ArrayExpress e GEO (do inglês Gene Expression Omnibus) para determinarmos as redes de expressão gênica que regulam sistemicamente a resposta imune ao SARS-CoV-2. Essa etapa será seguida por ensaios funcionais específicos de validação da triagem de alto rendimento (análises dos dados de RNAseq). Essa abordagem experimental em larga escala nos permitirá definir as assinaturas imunológicas, vias de sinalização e redes de co-expressão gênica e interações moleculares (interactoma) envolvidas na resposta imune contra o SARS-CoV-2.

    Perfil dos candidatos:

    a) Ter experiência/PhD nas áreas de Bioinformática, Imunologia, Biologia Molecular, Microbiologia, Parasitologia, Genética ou áreas relacionadas;
    b) Experiência com análise de dados de transcriptoma e bioinformática;
    c) Experiência em programação em R;
    d) Saber e gostar de trabalhar em equipe e de forma colaborativa;
    e) Fluente em inglês.

    Candidatos devem enviar para otavio.cmarques@gmail.com:

    - Curriculum Vitae, Carta de apresentação e 3 cartas de referências.

    A vaga está aberta a brasileiros e estrangeiros. O selecionado receberá Bolsa de Pós-Doutorado da FAPESP no valor de R$ 7.373,10 mensais e Reserva Técnica equivalente a 15% do valor anual da bolsa para atender a despesas imprevistas e diretamente relacionadas à atividade de pesquisa.

    A full-time post-doc position is available in the field of Systems Immunology, in the Department of Immunology of the Biomedical Sciences Institute of the University of São Paulo (ICB-USP), Brazil.

    The project aims to perform a systemic and integrative analysis of RNAseq data of immune cells available at databases such as ArrayExpress and GEO (Gene Expression Omnibus) to determine the networks of genes that regulate the immune response to SARS-CoV-2. This analysis will be followed by specific functional assays to validate the high-throughput screening. Our objective is to uncover new immunopathological mechanisms responsible for the severity of COVID-19 clinical manifestations. This high-throughput approach will allow us to define common and specific immunological signatures, signaling pathways, and molecular interactions (interactome) involved in the immune response against SARS-CoV-2.

    Eligibility / Qualification

    a) Ph.D. (Doctoral degree) in Bioinformatics, Immunology, Molecular Biology, Microbiology, Parasitology, Genetics, and/or related areas;
    b) Experience with transcriptomics and bioinformatics;
    c) Experience in programming using R;
    d) The candidate needs to like and to know how to work in a collaborative way;
    e) Fluent in English.

    Submit to otavio.otavio.cmarques@gmail.com:

    - Cover letter, curriculum vitae and 3 letters of reference

    This opportunity is open to candidates of any nationalities. The selected candidate will receive a Post-Doctoral fellowship from the São Paulo Research Foundation (FAPESPin the amount of R$ 7,373.10 monthly and a research contingency fund, equivalent to 15% of the annual value of the fellowship which should be spent in items directly related to the research activity.