Bolsa de PD em Produtos Naturais Microbianos

Post doctoral fellowship in Microbial Natural Products

Nº: 1131

Área de conhecimento: Química

Field of knowledge: Chemistry

Nº do processo FAPESP: 2013/50954-0

FAPESP process: 2013/50954-0

Título do projeto: Identificação de produtos naturais anti-parasitários produzidos por bactérias simbiontes de insetos

Project title: Identification of antiparasitic natural products produced by insect bacterial symbionts

Área de atuação: Química de Produtos Naturais Microbianos

Working area: Microbial Natural Products

Pesquisador responsável: Mônica Tallarico Pupo

Principal investigator: Mônica Tallarico Pupo

Unidade/Instituição: FCFRP / USP

Unit/Instituition: FCFRP / USP

Data limite para inscrições: 30/05/2016

Deadline for submissions: 2016-05-30

Publicado em: 04/05/2016

Publishing date: 2016-05-04

Localização: Avenida do Café, Ribeirão Preto

Locale: Avenida do Café, Ribeirão Preto

  • Resumo Summary

    Produtos naturais têm fornecido valiosos protótipos para o planejamento e desenvolvimento de fármacos, com o destaque recente que micro-organismos simbiontes podem produzir valiosos e promissores candidatos a protótipos.

    Este projeto ICBG é altamente focado na descoberta de agentes antifúngicos, antiparasitários e anticancerígenos.

    Desde sua descoberta, há várias décadas, a doença de Chagas e as leishmanioses apresentam vários desafios terapêuticos. Apesar de seus elevados impactos, milhões de pessoas são infectadas e milhares morrem anualmente, os poucos fármacos disponíveis apresentam diversas desvantagens, incluindo sérios efeitos colaterais e baixa eficácia.

    Portanto, existe uma necessidade urgente para o desenvolvimento de novos fármacos seguros e efetivos para atingir as necessidades terapêuticas dos indivíduos afetados.

    Este projeto de Pós-Doutorado irá priorizar linhagens bacterianas (principalmente isoladas de formigas) que foram previamente identificadas como ativas, em ensaios primários usando Trypanosoma cruzi e Leishmania donovani, como fontes de compostos antiparasitários. As linhagens bacterianas serão re-cultivadas em escala ampliada, os extratos serão preparados e os compostos serão isolados usando diferentes métodos cromatográficos. Esforços serão concentrados na caracterização estrutural de novos produtos naturais, usando extensivamente métodos de RMN e MS, além de outros que forem necessários.

    Principais atividades: O pós-doutorando irá cultivar novamente as linhagens bacterianas ativas em escala ampliada e trabalhar intensivamente no isolamento e identificação estrutural dos produtos naturais microbianos ativos com alto potencial contra parasitas. O pós-doutorando irá selecionar os métodos cromatográficos com base nas propriedades físico-químicas das amostras, os quais podem incluir cromatografia em coluna por exclusão, cromatografia em coluna de fase normal ou reversa, cromatografia líquida de alta eficiência (HPLC) acoplada aos detectores DAD e ELSD, etc. As estruturas químicas serão determinadas com base na combinação de diferentes técnicas, como Espectrometria de Massas de Alta Resolução (HRMS, MS/MS), Ressonância Magnética Nuclear (RMN de 1H e de 13C) e RMN 2D (HSQC, HMBC, COSY). Experimentos de efeito nuclear Overhauser (NOE) serão usados para determinação de configuração relativa. Determinações de configurações absolutas poderão requerer cristalização e cristalografia de raios-X. Derivatização química ou degradação podem auxiliar na determinação de configuração absoluta usando análises de Mosher e Marfey. Dicroísmo circular também poderá ser aplicado para determinação de configuração absoluta. As condições de cultura poderão ser modificadas a fim de aumentar os rendimentos dos produtos naturais bioativos (ex: nutrientes, tempo, aeração, pH, etc) e o pós-doutorando também estará encarregado de otimizar a produção dos compostos bioativos.

    Formação desejada: Farmacêuticos ou Químicos com experiência em química de produtos naturais microbianos (cultivo de bactérias, isolamento e identificação estrutural de produtos naturais microbianos).

    Inscrição: Interessados em participar da seleção devem encaminhar curriculum vitae (ou link do currículo Lattes para brasileiros), carta de interesse e duas cartas de recomendação para Mônica Tallarico Pupo (mtpupo@fcfrp.usp.br) (subject/assunto: ICBG postdoc opportunity).

    Natural products have provided valuable leads for drug design and development, with a special recent recognition of natural products produced by microbial symbionts as promising leads/drugs candidates.

    This ICBG is highly focused in the discovery of antifungal, antiparasitic and anticancer agents.

    Since their discovery many decades ago, Chagas' disease and leishmaniasis (protozoan diseases) still present major treatment challenges. Despite their high impact, millions are infected and thousands die annually, the few drugs available display numerous drawbacks, including serious side effects and low efficacy.

    Therefore, there is an urgent need for the development of safe and effective new medicines to meet the therapeutic needs of the affected individuals.

    This postdoctoral research project will prioritize bacterial strains (mainly isolated from ants) that have been found as active against primary assays using Trypanosoma cruzi and Leishmania donovani. Selected bacterial strains will be re-cultured in large scale, extracts will be prepared and compounds will be isolated using chromatographic methods. Large efforts will be concentrated in the structural identification of new natural products, using extensive NMR and MS methods.

    Main activities: The postdoctoral fellow will re-culture active bacterial strains in large scale and work intensively on the isolation and identification of bioactive microbial natural products with higher potential against parasites. The postdoc will select the chromatography methods for fractionation based on the physicochemical properties of samples, which may include exclusion column chromatography, normal and reversed phase column chromatography, high performance liquid chromatography (HPLC) using normal and reversed phases, coupled to DAD and ELSD detectors, etc. Structures will be determined based on a combination of different techniques, such as High resolution mass spectrometry (HRMS) and MS/MS, Nuclear Magnetic Resonance (1H NMR and 13C NMR) spectroscopy and 2D NMR (HSQC, HMBC, COSY). Relative stereochemistry can be determined by NMR experiments using the nuclear Overhauser effect (NOE). Absolute stereochemistry determination may require crystallization and X-ray crystallography. Chemical derivatization or degradation may help absolute configuration determination using Mosher's and Marfey's analysis. Circular dichroism might also be applied for absolute configuration determination. Culturing conditions can be modified in order to enhance yields of bioactive natural products (e. g.: nutrients, time, aeration, pH) and the postdoc will be in charge of optimize bioactive compounds production.

    Background: Pharmacists or Chemists with previous experience in Microbial Natural Products Chemistry (bacteria culturing, isolation and structural identification of microbial natural products).

    Application: Send biosketch or curriculum vitae (CV Lattes for Brazilians), motivation letter for this position and two recommendation letters to mtpupo@fcfrp.usp.br (subject: ICBG postdoc opportunity).

    This opportunity is open to candidates of any nationalities. The selected candidate will receive a FAPESP's Post-Doctoral fellowship in the amount of R$ R$ 6.819,30 monthly and a research contingency fund, equivalent to 15% of the annual value of the fellowship which should be spent in items directly related to the research activity. 

    More information about the fellowship is at: www.fapesp.br/en/5427.