Bolsa de TT-IV-A em Bioinformática
Level 4A-Technical Training Fellowship in Bioinformatics
Nº: 3207
Área de conhecimento: Ciência da Computação
Field of knowledge: Computer science
Nº do processo FAPESP: 2018/00031-7
FAPESP process: 2018/00031-7
Título do projeto: Estudos sobre comparação de genomas
Project title: Studies on genome comparison
Área de atuação: Bioinformática
Working area: Bioinformatics
Quantidade de vagas: 1
Number of places: 1
Início: 01/02/2019
Start: 2019-02-01
Pesquisador responsável: João Meidanis
Principal investigator: João Meidanis
Unidade/Instituição: Instituto de Computação / Unicamp
Unit/Instituition: Instituto de Computação / Unicamp
Data limite para inscrições: 31/12/2019
Deadline for submissions: 2019-12-31
Publicado em: 27/09/2019
Publishing date: 2019-09-27
Localização: Av Albet Einstein, 1251, Campinas
Locale: Av Albet Einstein, 1251, Campinas
E-mail para inscrições: meidanis@scylla.com.br
E-mail for proposal submission: meidanis@scylla.com.br
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Resumo
Este projeto busca avançar a teoria matricial de rearranjo de genomas, aplicando-a à construção de filogenias usando rearranjos e a inferência dos genomas ancestrais nos nós internos. E também a refinar os métodos, aperfeiçoando os algoritmos que os implementam.
Descrição das vagas:
A pessoa contemplada deverá se familiarizar com os programas já desenvolvidos por nosso grupo e auxiliar-nos a criar um repositório para compartilhá-los. Deverá também verter os programas escritos em Matlab ou Octave para Python e R.
Atividades:
- Estudo da teoria matricial de rearranjos (4 meses);
- Organização de repositório GitHub ou equivalente, permissões, política de atualização, etc. (1 mês);
- Tradução de programas de Matlab/Octave para Python e R (3 meses);
- Disponibilização dos programas no repositório (1 mês).Benefícios e Requisitos:
A pessoa selecionada receberá uma bolsa de Treinamento Técnico Nível TT4A fornecida pela FAPESP, para dedicação em tempo integral, com valor mensal de R$ 5.087,20 e duração de 09 meses.
Os candidatos ideais deverão possuir desenvoltura em Python, Matlab, R e Octave. Além disso, deverão ter familiaridade com ferramentas de bioinformática e proficiência em álgebra linear.
Demais requisitos e benefícios estão disponíveis no site www.fapesp.br/bolsas/tt.
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Oportunidade - Oportunidades Abertas Open Opportunities
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