Bolsa de PD em Protozoologia Molecular

Post-doctoral Fellowship in Molecular Protozoology

• Resumo Summary

  O projeto a ser desenvolvido é para uma bolsa de pós-doutorado, contemplada como item orcamentário do Projeto Temático FAPESP (processo 2018/04375-2), coordenado pela Professora Associada Maria Isabel N. Cano. 

  Habilidades e experiência desejadas

  1. Idealmente, o bolsista de pós-doutorado deve ter experiência em trabalhar com Leishmania e ou em área relacionada ao Projeto;

  2. Doutorado em uma das seguintes áreas: genética, biologia molecular, bioquímica (obrigatório);

  3.Título de doutor não pode ter sido obtido há mais de cinco anos da data limite para inscrição;

  3. Experiência em técnicas de biologia molecular/ bioquímica (obrigatório);

  4. Experiência em técnicas de microbiologia e protozoologia (manutenção de culturas, inoculação de parasitos em animais de laboratório, infecção de cultura de macrófagos);

  5. Experiência na identificação e caracterização de longos RNAs não codificadores (obrigatório);

  6. Experiência com bioinformática aplicada à transcriptoma e montagem de repositórios para acessar dados de sequenciamento (obrigatório);

  7. Experiência com programação (desejável);

  8. Experiência com softwares variados, incluindo os de análise de dados genômicos (ex. Artemis, MEGA) e análise de imagens (ex. Gimp);

  9. Ter co-orientado estudantes de iniciação e pós-graduação;

  10. Proficiência em inglês escrito e falado;

  11. Liderança e trabalho em grupo;

  12. Disponibilidade para estagiar no exterior;

  13. Julgamento científico. 

  Inscrição

  Os candidatos à bolsa devem enviar por e-mail para maria.in.cano@unesp.br:

  a. Carta indicando o motivo do interesse no projeto e uma breve descrição da experiência anterior;

  b. Súmula curricular FAPESP confirmando no mínimo três publicações em revistas indexadas com índice de impacto maior que 3,0;

  c. Duas cartas de referência de pesquisadores da área que se insere o projeto;

  d. Disponibilidade para entrevista via Skype.

  Resumo do projeto a ser desenvolvido

  Estudar o papel do RNA longo não codificador telomérico TERRA (“TElomeric Repeat-containing RNA”) na regulação da manutenção dos telômeros e na senescência replicativa em Leishmania major. 

  Entre os principais objetivos a serem alcançados estão:

  1. Identificar as proteínas com função telomérica que interagem com o TERRA; 

  2. Verificar qual TERRA regula a manutenção dos telômeros de L. major e a senescência replicativa

  a. realizando análise transcriptômica de diferentes estágios de vida dos parasitos e de parasitos com diferentes duplicações populacionais seguido de validação experimental;

  b. induzindo nocaute do TERRA via CRISPR-Cas9 e analisando o fenótipo do mutante em relação a alterações no tamanho dos telômeros, na proliferação celular, no ciclo celular, na função mitocondrial e na sua capacidade de infectar in vivo. 

  A vaga está aberta a brasileiros e estrangeiros. O selecionado receberá Bolsa de Pós-Doutorado da FAPESP no valor de R$ 7.373,10 mensais e Reserva Técnica equivalente a 15% do valor anual da bolsa para atender a despesas imprevistas e diretamente relacionadas à atividade de pesquisa.

  The project to be developed by the candidate is for a post-doctorate fellowship linked to a Research Project funded by the São Paulo Research Foundation – FAPESP (grant # 2018/04375-2) under the coordination of Associate Professor Maria Isabel N. Cano from Botucatu Biosciences Institute of São Paulo State University – UNESP, Brazil.

  The post-doctorate candidate must present the following skills

  1. Ideally, he/she must have experience in work with Leishmania or in an area related to the project;

  2. Must have a PhD. in genetics, molecular biology or biochemistry;

  3. Must have got the PhD. five years before (at maximum) the deadline of this announcement;

  4. Must show experience in microbiology and parasitology techniques (parasite and bacterial cultures maintenance, mice infection and macrophage infection);

  5. Must have worked in the identification and characterization of noncoding RNAs;

  6. Must show experience in bioinformatics applied to transcriptome analysis and in build repository site for the accession of big data sequence;

  7. Experience in programming (desirable);

  8. Experience in using a variety of softwares for genome analysis (i.e. Artemis, Mega) and image analysis (i.e. GIMP);

  9. Confirmed experience in co-supervision of undergrad and graduate students;

  10. English proficiency;

  11. To be a leader and work in a group;

  12. Availability to work abroad for a short period;

  13. Scientific judgment. 

  Registration

  The interested should send an email to maria.in.cano@unesp.br containing:

  a) a motivation letter and a brief description of his/her skills

  b) a resume or summary CV (FAPESP model) showing a list of a minimum of 3 publications in scientific journals with editorial policies (expect Impact Factor > 3)

  c) 2 reference letters from reputed researchers

  d) a skype address for the interview

  Information About Project

  The post-doctorate project is about the role played by the telomeric long noncoding RNA, TERRA (“TElomeric Repeat-containing RNA”) in telomere length regulation and replicative senescence in Leishmania major. 

  The specific goals are:

  1. To identify telomeric proteins that interact with TERRA (using IP and RTqPCR)

  2. To identify the lncRNA TERRA involved with parasite telomere length regulation and replicative senescence by

  a. using transcriptome analysis of parasites from different life stage and with different population doubling followed by experimental validation);

  b. inducing TERRA knockout (via CRISPR-Cas9 system) and checking alterations in parasite morphology, in the parasite cell cycle, cell proliferation, telomere length, mitochondrial function, and infectivity capacity.

  This opportunity is open to candidates of any nationalities. The selected candidate will receive a FAPESP’s Post-Doctoral fellowship in the amount of R$ 7,373.10 monthly and a research contingency fund, equivalent to 15% of the annual value of the fellowship which should be spent in items directly related to the research activity.