Bolsa de PD em Bioquímica

Post doctoral fellowship in Biochemistry

• Resumo Summary

  O candidato(a) selecionado(a) irá trabalhar no Laboratório de Fisiologia Ecológica de Plantas do Instituto de Biociências da Universidade de São Paulo. 
  
  Experiência em Biologia Molecular é imprescindível no que diz respeito à extração de RNA, preparo de bibliotecas para sequenciamento, clonagem e análises de expressão gênica por RNAseq, microarray e qPCR. 
  
  Experiência em cana-de-açúcar, conhecimento em bioquímica de parede celular e fisiologia da resposta a estresses ambientais são desejáveis, bem como noções básicas de bioinformática. 
  
  O(A) bolsista será responsável pelo sequenciamento de transcriptoma (microRNA) de raiz de cana-de-açúcar, desde a preparação das amostras até o processamento das reads obtidas em pipelines já estabelecidos em nosso grupo, bem como da análise dos dados. 
  
  Tal análise deverá ser feita em conjunto com o banco de dados de mRNA e proteínas já disponível em nosso laboratório, visando uma análise integrativa dos dois transcriptomas com a proteômica. 
  
  Ele/Ela irá auxiliar na interpretação de dados de metabolômica obtidos de sorgo crescido em diferentes condições experimentais (CO2 elevado e seca), produzido em colaboração com o Departamento de Genética Molecular da Universidade Estadual de Ohio (EUA).
  
  O candidato(a) irá também colaborar na validação dos dados de metabólitos por meio da análise da expressão gênica de candidatos alvo, de modo a integrar a escala transcricional aos dados fisiológicos e metabólicos já existentes. 
  
  O candidato(a) atuará, portanto, em conjunto com membros do grupo na montagem de sistemas de visualização da integração entre fisiologia, expressão gênica e metabolismo em modelos vegetais, em colaboração com o Instituto de Matemática e Estatística (IME) da USP e a Microsoft Research.
  
  Para se inscrever, o candidato deve enviar Currículo Vitae e carta de apresentação para o e-mail msbuck@usp.br, que também deverá ser utilizado para o caso de dúvidas. A data-limite para inscrições é 20 de junho de 2015.
  
  O selecionado receberá Bolsa de Pós-Doutorado da FAPESP (no valor de R$ 6.143,40 mensais) e Reserva Técnica. A Reserva Técnica de Bolsa de PD equivale a 15% do valor anual da bolsa e tem o objetivo de atender a despesas imprevistas e diretamente relacionadas à atividade de pesquisa.

  The selected candidate will work at the Laboratory of Plant Physiological Ecology of the Institute of Biosciences of the University of São Paulo. 
  
  Experience in Molecular Biology is essential in which concerns RNA extraction, preparation of libraries for sequencing, cloning, gene expression analysis by RNAseq, microarray and qPCR. 
  
  Previous experience with sugarcane and knowledge on polysaccharide biochemistry and plant physiological responses to stress are desired, as for basic understanding in bioinformatics tools. 
  
  The selected candidate will be responsible for preparing microRNA libraries from sugarcane roots for RNAseq, processing the obtained reads into the pipeline assemblying already developed in our lab.
   
  The data analysis should be done along with protein and transcriptional (mRNA) data already assembled aiming at integrating transcriptional and proteomics data. 
  
  He/she will participate in the interpretation of metabolomics data obtained with sorghum samples (grown in elevated CO2 and drought), produced in collaboration with Ohio State University (USA) and the candidate shall also validate metabolite profiles by analysing gene expression patterns. 
  
  The transcriptional data will thus be integrated to the physiological and metabolite profiles by the candidate. He/she will then work together with other members in the group in the assembling of visualization tools that will be developed with transcriptional, protein, metabolite and physiological data, in collaboration with Math and Statistics Institute (IME/USP) and Microsoft Research.
  
  For further information, please contact: msbuck@usp.br.
  
  This opportunity is open to candidates of any nationalities. The selected candidate will receive a FAPESP's Post-Doctoral fellowship in the amount of R$ 6,143.40 (around 2,600 USD) monthly and a research contingency fund, equivalent to 15% of the annual value of the fellowship which should be spent in items directly related to the research activity. 
   
  More information about the fellowship is at: www.fapesp.br/en/5427.