Bolsa de DD em Bioquímica

PhD fellowship in Biochemistry

• Resumo Summary

  O núcleo contém proteínas essenciais para a manutenção e regulação do genoma transformando sinais extracelulares e intracelulares em alterações da expressão gênica e alterações fenotípicas. 
  
  Neste projeto pretendemos realizar, em larga escala, análises comparativas e quantitativas do proteoma nuclear em diferentes fases do ciclo celular e na senescência de células tumorais de camundongo estimuladas com FGF2. 
  
  Para tal, os extratos nucleares serão analisados sistematicamente por espectrometria de massas, o que permitirá investigar em maiores detalhes proteínas intimamente relacionadas no gerenciamento da expressão gênica, do fenótipo celular, na mediação da replicação celular, no remodelamento da cromatina e no reparo e dano do DNA.
   
  Para as análises quantitativas, utilizaremos duas abordagens: Spike-in SILAC e quantificação do tipo label free. A partir de uma intensa análise por bionformática, integrando os dados aqui obtidos com dados da literatura, dados de vias de sinalização e demais informações públicas, acreditamos ser possível identificar moléculas-chave responsáveis pela indução e manutenção dos bloqueios no ciclo celular e na senescência induzidas por FGF2, além de permitir o melhor entendimento da biologia do ciclo celular e biologia tumoral.
  
  Interessados na seleção, favor enviar currículo e histórico escolar para julia.cunha@butantan.gov.br.

  The nuclei contains proteins essential for genome maintenance and regulation that are responsible for gene expression and phenotypic changes. 
  
  In this project we intend to develop large-scale quantitative and comparative analysis of the nuclear proteome at different phases of cell cycle and senescence of mice tumor cells stimulated with FGF2. 
  
  To this end, nuclear extracts will be systematically analyzed by mass spectrometry. For quantitative analysis, we will use two approaches: Spike-in SILAC and quantification of label type free. 
  
  After an intense bioinformatic analysis that will integrate the data obtained here with literature data, signaling pathways and other public information, we believe it will be possible to identify key molecules responsible for the induction and maintenance of cell cycle blockage and senescence induced by FGF2. Besides that, it will allow a better understanding of cell cycle and tumor biology.
  
  For further information please contact julia.cunha@butantan.gov.br.