Bolsa de PD em Bioquímica e Biologia Molecular de Plantas

Post doctoral fellowship in Biochemistry and Plant Molecular Biology

• Resumo Summary

  A cana-de-açúcar é uma das principais culturas no mundo na produção de açúcar e biocombustíveis. A biotecnologia para o melhoramento da cana-de-açúcar será beneficiada com a definição de um genoma de referência.
   
  Atualmente, estamos sequenciando o genoma da cana-de-açúcar utilizando diversas estratégias que incluem a obtenção de sequências de whole genome shotgun e RNA-seq. 
  
  Este projeto é realizado em colaboração com diversos grupos de pesquisa do Brasil, Europa e da Microsoft Research Institute dos EUA. 
  
  A produção de um genoma de referência da cana-de-açúcar e o desenvolvimento de um algoritmo para identificação de alelos nos dados de sequenciamento requer candidatos à vaga de pós-doutorado altamente qualificados, capazes de supervisionar a obtenção e análise dos dados de sequenciamento assim como o desenvolvimento de ferramentas de bioinformática. 
  
  O candidato deve ser um biólogo molecular com experiência em sequenciamento e bioinformática. O pós-doutor terá que interagir, supervisionar e orientar técnicos e um bioinformata sênior para definir os programas e o uso das ferramentas. 
  
  O candidato trabalhará nas facilities de sequenciamento para supervisionar, solucionar problemas e aperfeiçoar a geração e análise dos dados, e com os bioinformatas para orientar a criação de interfaces para acesso web e datamining pelos membros do grupo. 
  
  O candidato será o avaliador primário dos dados, trabalhando para desenvolver um pipeline para análise e compartilhamento dos dados de sequenciam ento. 
  
  Para candidatar-se, favor enviar um CV e uma carta de referência para glmsouza@iq.usp.br. Favor escrever “Postdoctoral candidate” no assunto do e-mail. A data limite para inscrições é 30 de abril de 2014.

  Sugarcane is a major crop for sugar and biofuel production throughout the world. Biotechnology for this crop’s improvement could profit from a definition of a reference genome. 
  
  We are currently sequencing the sugarcane genome using several strategies that include obtaining whole genome shot-gun data and RNA-Seq. 
  
  This project is carried out in collaboration with several research groups from Brazil, Europe and Microsoft Research Institute from the USA. 
  
  The production of a working draft of the sugarcane genome and the development of an algorithm for allele identification within sequencing data demands a highly skilled post-doctoral candidate that can oversee sequence data obtainment and analysis as well as bioinformatics tool development.
   
  The candidate should be a molecular biologist with sequencing experience and bioinformatics expertise. The post-doc will have to interact, oversee and guide technicians and a senior bioinformatician to define programs and the use of tools. 
  
  The candidate will be working with the sequencing facilities to oversee, trouble shoot and optimize data generation and analysis and with the bioinfo developers to guide the creation of interfaces for web access and datamining by group members. 
  
  The candidate will be the primary data evaluator working to develop the pipeline for sequence data analysis and sharing.
  
  For further information, please contact glmsouza@iq.usp.br.