Bolsa de PD em Bioinformática / Biologia de Sistemas

Post-Doctoral Fellowship in Bioinformatics / Systems Biology

Nº: 4611

Área de conhecimento: Biologia Geral

Field of knowledge: General biology

Nº do processo FAPESP: 2013/08216-2

FAPESP process: 2013/08216-2

Título do projeto: CRID – Centro de Pesquisa em Doenças Inflamatórias

Project title: CRID – Center for Research in Inflammatory Diseases

Área de atuação: Farmacologia Molecular, Bioinformática e Biologia de Sistemas

Working area: Systems Biology, Bioinformatics and Computational Biology

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Pesquisador responsável: Fernando de Queiroz Cunha

Principal investigator: Fernando de Queiroz Cunha

Unidade/Instituição: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP-USP)

Unit/Instituition: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP-USP)

Data limite para inscrições: 15/11/2021

Deadline for submissions: 2021-11-15

Publicado em: 19/10/2021

Publishing date: 2021-10-19

Localização: Av. Bandeirantes, 3900 – Rua das Paineiras, Casa 03 – Vila Monte Alegre, Ribeirão Preto

Locale: Av. Bandeirantes, 3900 – Rua das Paineiras, Casa 03 – Vila Monte Alegre, Ribeirão Preto

E-mail para inscrições: hnakaya@usp.br

E-mail for proposal submission: hnakaya@usp.br

  • Resumo Summary

    Uma vaga de pós-doutorado em bioinformática / biologia de sistemas com foco em análise transcriptômica está disponível no Centro de Pesquisa em Doenças Inflamatórias – CRID (http://crid.fmrp.usp.br), um Centro de Pesquisa, Inovação e Difusão (CEPID) apoiado pela FAPESP com sede na Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo. O candidato bem-sucedido se juntará ao Laboratório de Biologia de Sistemas Computacional (CSBL, https://www.csbiology.org). As atividades serão supervisionadas pelo Prof. Helder Nakaya.

    Responsabilidades

    O candidato trabalhará nas dependências do CRID, localizado na USP de Ribeirão Preto. Espera-se que o bolsista desempenhe papel de liderança na análise de dados, que inclui a integração de dados ômicos e o desenvolvimento de modelos preditivos e hipóteses testáveis.

    As responsabilidades específicas incluem:

    - Desenvolvimento de protocolos de análise para conjuntos de dados internos e públicos de expressões gênicas;

    - Desenvolvimento ou adaptação de ferramentas e scripts de software para atender às necessidades do projeto.

    Requisitos

    O candidato deverá ter experiência comprovada em pesquisa de bioinformática. A familiaridade com o trabalho em um ambiente Linux/Unix, além de fluência em linguagens de programação R ou Python, é necessária;

    Por favor, envie seu currículo com informações de contato, uma carta de motivação e pelo menos 2 cartas de recomendação ao Prof. Helder Nakaya, e-mail: hnakaya@usp.br.

    A vaga está aberta a brasileiros e estrangeiros. O selecionado receberá Bolsa de Pós-Doutorado da FAPESP no valor de R$ 7.373,10 mensais e Reserva Técnica equivalente a 10% do valor anual da bolsa para atender a despesas imprevistas e diretamente relacionadas à atividade de pesquisa.

    One post-doctoral position in Bioinformatics / Systems Biology with a focus on Transcriptomics Analysis is available at the Center for Research in Inflammatory Diseases – CRID. The successful applicant will join the Computational Systems Biology Laboratory (CSBL). His/her activities will be supervised by Professor Helder Nakaya.

    Responsibilities

    The candidate will work at CRID, one of the Research, Innovation and Dissemination Centers (RIDCs) supported by the São Paulo Research Foundation (FAPESP), based in the Ribeirão Preto Medical School of the University of São Paulo (FMRP-USP), Brazil. The fellowship holder must play a leading role in data analysis, including the integration of omics data and developing predictive models and testable hypotheses.

    The specific responsibilities include:

    - Development of analysis protocols for in-house, and public gene-expression datasets;

    - Development or adaptation of software tools and scripts to meet project needs.

    Job Requirements

    The qualified applicant must have demonstrated experience in bioinformatics research. Familiarity with working in a Linux / Unix environment, plus fluency in R or Python programming languages are required.

    Please submit your résumé (CV) with contact information, a motivation letter, and at least 2 letters of recommendation to Prof. Helder Nakaya, email hnakaya@usp.br.

    This opportunity is open to candidates of any nationality. The selected candidate will receive a FAPESP’s Post-Doctoral fellowship in the amount of R$ 7,373.10 monthly and a research contingency fund, equivalent to 10% of the annual value of the fellowship which should be spent in items directly related to the research activity.